结论：消失几十年的父亲是否可以参与工亡赔偿款的分配，需根据具体情况判断，主要取决于其是否仍具有法律上的继承人身份以及是否存在其他法定继承人。
分析：
法律上的继承人身份：
- 根据《中华人民共和国民法典》继承编的相关规定，配偶、子女、父母是第一顺序的法定继承人。这里的“子女”包括婚生子女、非婚生子女、养子女和有扶养关系的继子女，“父母”则包括生父母、养父母和有扶养关系的继父母。
- 如果消失几十年的父亲在法律上仍然被认定为工亡者的生父，且未被依法宣告死亡或失踪，那么他理论上具有继承权，可以参与工亡赔偿款的分配。
实际继承情况：
- 然而，在实际操作中，还需要考虑其他因素。例如，如果工亡者有其他第一顺序的法定继承人（如配偶、其他子女、养父母等），那么工亡赔偿款将在这些继承人之间按照法定继承或遗嘱继承（如果存在遗嘱）的原则进行分配。
- 如果消失几十年的父亲长期未与工亡者联系，且未尽到作为父亲的责任和义务，其他继承人可能会对其继承权提出异议。在这种情况下，可能需要通过法律程序（如诉讼）来确定其继承权的有无及份额。
宣告死亡或失踪的影响：
- 如果消失几十年的父亲已经被依法宣告死亡或失踪，那么他将不再具有继承权。此时，工亡赔偿款将由其他第一顺序的法定继承人分配。
- 如果之后该父亲重新出现，他可以根据相关法律规定申请恢复继承权，但这需要经过一系列的法律程序，并且不一定能够成功恢复。
建议：
- 如果您面临这种情况，建议首先收集相关证据（如工亡者的死亡证明、家庭关系证明、父亲的失踪或宣告死亡证明等），以明确各方的法律地位和继承权。
- 然后，可以尝试与其他继承人进行协商，达成一致的分配方案。如果协商不成，可以考虑通过法律途径解决争议，如向法院提起继承权纠纷诉讼。
- 在整个过程中，建议咨询专业律师的意见，以确保您的权益得到充分保护。
法律后果：
- 如果消失几十年的父亲被确认具有继承权，他将有权参与工亡赔偿款的分配，并可能获得一定份额的赔偿款。
- 如果其继承权被否认或丧失，他将无法获得工亡赔偿款，且可能面临其他法律后果（如如果其失踪或宣告死亡是基于欺诈等违法行为，可能需要承担相应的法律责任）。