当法院判决船舶买卖合同无效时，卖方可以通过以下途径维护自身合法权益，我将分情况详细说明：

1. 分析合同无效的原因及责任归属
   首先需明确合同被认定无效的具体原因（如违反法律强制性规定、恶意串通损害他人权益、主体资格瑕疵等）。根据《民法典》第157条，合同无效后，因该合同取得的财产应当返还；不能返还或没必要返还的，应折价补偿；有过错的一方需赔偿对方损失，双方均有过错的则按过错比例分担。

   • 若卖方无过错：可主张买方返还船舶，并要求买方赔偿因合同无效导致的损失（如船舶保管费、市场价值贬损等）。
     
   • 若卖方存在过错（如隐瞒船舶权属瑕疵）：需承担相应赔偿责任，但可主张买方返还已支付的价款，并要求按过错比例分担损失。

2. 主张返还财产与折价补偿

   • 船舶已交付但未过户：卖方可要求买方返还船舶，并配合办理过户撤销手续。若船舶已被转卖或灭失，可要求买方折价补偿（按市场价或评估价）。
     
   • 价款已支付但未交付船舶：卖方需返还买方已支付的价款，但可主张买方赔偿因合同无效导致的损失（如利息损失、交易机会损失等）。

3. 抗辩买方的赔偿请求
   若买方主张赔偿（如预期利益损失），卖方可从以下角度抗辩：

   • 买方明知合同无效仍继续履行：若买方在签订合同时已知或应知合同无效（如船舶存在权属争议），其损失可能不被法院支持。
     
   • 损失扩大责任：若买方未及时采取止损措施（如继续使用船舶导致价值贬损），卖方可主张买方自行承担扩大损失部分。
     
   • 过错比例：若双方均有过错，卖方可要求按过错比例分担损失，降低自身赔偿金额。

4. 申请财产保全或执行异议

   • 若买方拒不返还船舶或价款：卖方可向法院申请强制执行，要求买方履行返还义务。
     
   • 若船舶已被查封或拍卖：卖方可提出执行异议，主张对船舶的所有权或优先受偿权（如保留所有权条款有效时）。

5. 追究第三人责任（如存在）
   若合同无效因第三人行为导致（如中介机构伪造文件、登记机关错误登记），卖方可向第三人主张侵权责任，要求赔偿损失。

行动建议：

1. 立即收集并固定证据（如合同、付款记录、船舶交付凭证、沟通记录等），以证明自身无过错或过错程度较低。
   
2. 委托专业律师评估合同无效原因及责任比例，制定针对性维权策略。
   
3. 根据案件进展，灵活运用返还财产、赔偿损失、抗辩等法律手段，最大限度维护自身权益。
   

如有进一步疑问或需具体操作指导，可直接向我咨询。