结论：员工没有三轮车驾驶证撞了小车，保险公司是否理赔需分情况讨论，主要取决于保险类型以及保险合同中的具体条款约定。以下为详细分析：

1. 交强险部分
   三轮车若属于机动车范畴（如电动三轮车被鉴定为机动车），则需依法投保交强险。根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十二条，若驾驶人未取得驾驶资格发生事故，保险公司仅在医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额内垫付抢救费用，并有权向致害人追偿；对于死亡伤残赔偿和其他财产损失，保险公司不承担赔偿责任。因此，若员工无证驾驶导致小车受损，交强险对小车的财产损失（如维修费）通常不予理赔，但可能垫付伤者医疗费（如有）。

2. 商业险部分
   商业险（如第三者责任险、车损险）的理赔需严格依据保险合同条款。若合同中明确约定“无有效驾驶证驾驶机动车”属于免责情形（此类条款在商业险中极为常见），则保险公司可直接拒赔。即使合同未明确排除，根据《保险法》第十七条，保险公司若已对免责条款尽到提示和明确说明义务，该条款仍有效，保险公司可据此拒赔。因此，商业险大概率不予理赔，除非员工能证明保险公司未履行提示说明义务（但实践中此类举证难度极高）。

3. 特殊情形
   若三轮车被认定为非机动车（如部分地区对电动三轮车的认定标准不同），则无需交强险，事故责任完全按侵权责任处理。此时保险公司是否理赔取决于小车车主投保的险种（如车损险），但员工无证驾驶的行为仍可能构成保险公司拒赔的合理依据（需结合具体合同条款）。

建议：

• 员工方：若已造成人身伤害，可尝试与小车车主协商赔偿；若涉及工伤，可依法申请工伤认定（但无证驾驶可能影响工伤认定结果）。
  
• 小车车主方：若车辆受损，可要求员工或其雇主承担赔偿责任；若投保车损险，可尝试向保险公司索赔（但需做好被拒赔的心理准备）。
  

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