结论：在此情况下，是否使用商业险取决于您个人的选择以及保险条款的具体规定，但从法律和经济的角度，有几种情况可以考虑。
一、法律角度分析
同责情况下的赔偿原则：
- 在交通事故中，如果双方同责，通常意味着各自承担自己的损失，或者按照一定比例（如50%）分担对方的损失。但具体赔偿方式可能因地区和保险条款的不同而有所差异。
保险赔偿的顺序：
- 一般来说，先由交强险在责任限额内进行赔偿。交强险的赔偿限额通常包括死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额。
- 如果交强险的赔偿限额不足以覆盖损失，再考虑使用商业险进行赔偿。
二、经济角度分析
使用商业险的成本与收益：
- 成本：使用商业险可能会影响您未来的保费。保险公司可能会根据您的理赔记录调整保费，理赔次数越多，保费可能越高。
- 收益：如果您选择使用商业险来赔偿自己的损失（尽管在此情况下您也有责任赔偿对方），那么您可以避免自己承担全部或部分维修费用。但考虑到您只需承担1000元的维修费用，而对方的维修费用为4000元，且双方同责，实际上您可能只需承担对方损失的一部分（如2000元，如果按50%比例分担），而您的1000元损失可能由自己的交强险或商业险（如果购买了车损险）来覆盖。
不使用商业险的情况：
- 如果您选择不使用商业险，而是自己承担1000元的维修费用，那么这不会影响您未来的保费。同时，您也可以与对方协商，看是否能够通过其他方式（如对方也承担部分您的损失）来达成和解。
三、具体建议
查看保险条款：
- 首先，您需要仔细查看自己的保险条款，了解交强险和商业险的具体赔偿范围和限额，以及理赔对保费的影响。
评估损失与保费影响：
- 评估自己承担1000元维修费用与使用商业险理赔后可能增加的保费之间的经济关系。如果增加的保费远高于1000元，那么不使用商业险可能更为经济。
与对方协商：
- 您可以与对方协商，看是否能够达成一个双方都能接受的赔偿方案。例如，您可以提出各自承担自己的损失，或者按照一定比例分担对方的损失，而不涉及商业险的使用。
考虑未来保费：
- 如果您担心使用商业险会影响未来保费，且您的维修费用不高，那么您可以考虑自己承担这部分费用。
示例说明：假设您的商业险保费每年为5000元，且根据保险公司的规定，每次理赔后保费将增加10%。如果您选择使用商业险来赔偿1000元的维修费用，那么您未来一年的保费将增加至5500元。而如果您选择自己承担这1000元费用，则保费保持不变。在这种情况下，自己承担费用可能更为划算。
最后建议：如果您对此仍有疑问或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况和当地的法律法规，为您提供更详细的解答。