结论前置：在公诉案件中，共同犯罪一般应一并起诉，但在特定情形下也可以单独起诉；在自诉案件中，共同犯罪可以单独起诉。以下是对这一问题的详细分析：
一、公诉案件中的共同犯罪起诉规则
一般原则：
- 在我国刑事诉讼活动中，对于共同犯罪案件，原则上应当对所有涉案犯罪嫌疑人一并起诉。这是因为共同犯罪涉及多个犯罪嫌疑人的共同行为，一并起诉有助于查清案件事实，准确界定各犯罪嫌疑人的责任。例如，在一个盗窃团伙案件中，所有参与盗窃的成员都应当被一并起诉，以便全面审理他们的共同行为和各自的责任。
特定情形下的单独起诉：
- 然而，在司法实践中，也存在对部分犯罪嫌疑人单独起诉的例外情况。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，检察机关有权根据案件的具体情况，对符合起诉条件的犯罪嫌疑人提起公诉。这些特定情形包括但不限于：
- 部分嫌疑人在逃，短期内无法到案，而现有证据已经达到对在案犯罪嫌疑人提起公诉的标准。例如，在一个诈骗案件中，部分嫌疑人潜逃国外，而现有证据已经足够证明在案嫌疑人的犯罪事实，此时可以对在案嫌疑人单独起诉。
- 部分犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，而其他犯罪嫌疑人的犯罪事实还需要进一步侦查。例如，在一个共同抢劫案件中，部分嫌疑人的犯罪事实已经查清，而其他嫌疑人的身份或犯罪行为还需要进一步调查，此时可以对已查清事实的嫌疑人单独起诉。
- 部分嫌疑人认罪认罚，与司法机关达成了认罪认罚具结书，并且案件事实清楚、证据充分。在这种情况下，为了加快诉讼进程，提高诉讼效率，可以对认罪认罚的嫌疑人单独起诉。
二、自诉案件中的共同犯罪起诉规则
自诉案件的特点：
- 与公诉案件不同，自诉案件是由被害人或其法定代理人直接向人民法院提起诉讼的案件。在自诉案件中，若存在共同犯罪人，自诉人在起诉时可以选择只针对部分共同犯罪人提起诉讼。法律并未要求必须对所有共同犯罪人一并提起诉讼。例如，在一个故意伤害案件中，如果被害人只愿意起诉其中一个加害人，而放弃对其他加害人的起诉，这是被法律所允许的。
法律依据：
- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》第三百二十条第二款明确规定了自诉案件中可以单独起诉的情形。这意味着在自诉案件中，自诉人具有更大的灵活性来选择起诉对象。他们可以根据自己的意愿和案件的具体情况，自由选择对部分或全部共同犯罪人提起诉讼。
三、实际应用指导
- 在处理共同犯罪案件时，应首先确定案件的性质（公诉案件还是自诉案件），然后根据相关法律法规和司法解释的规定来判断是否可以单独起诉。
- 对于公诉案件中的共同犯罪，若存在特定情形（如在逃、犯罪事实清楚且证据充分、认罪认罚等），检察机关可以考虑对部分犯罪嫌疑人单独起诉。
- 对于自诉案件中的共同犯罪，自诉人可以自由选择对部分或全部共同犯罪人提起诉讼。
综上所述，共同犯罪的起诉规则并非一成不变，而是根据案件的具体情况和法律规定来灵活运用的。在实际操作中，应充分考虑案件的实际情况和法律规定，以确保起诉的合法性和有效性。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。