针对您提出的“村代建协议无公章是否有效”的问题，这确实是一个涉及合同效力的关键问题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，公章在合同签订中通常被视为确认合同内容、表明合同双方意愿的重要法律符号。然而，公章并非合同生效的唯一条件。合同的有效性主要取决于合同双方是否真实表达了意愿，并且合同内容不违反法律法规的强制性规定。

在村代建协议的情境中，如果协议虽然未加盖公章，但双方（即村方和代建方）已经通过其他方式（如签字、口头确认并后续实际履行等）表达了真实的意愿，并且协议内容合法合规，那么这份协议在法律上仍然可能是有效的。特别是当协议已经实际履行，且双方对协议内容无异议时，公章的缺失可能不会影响协议的效力。

但需要注意的是，如果协议未加盖公章，且存在一方对协议内容有异议、协议内容存在违法违规情况，或者无法证明双方已经真实表达了意愿等情形，那么这份协议可能会面临无效或可撤销的风险。

此外，表见代理的情况也值得关注。如果代建方的工作人员在签订协议时，虽然未获得明确的授权，但其行为足以让村方相信其有代理权（如持有代建方的制式合同、在代建方的工地现场签订等），并且村方在签订协议时属善意且无过失，那么这种情况下签订的协议也可能被认定为有效，即构成表见代理。

建议：

1. 尽量加盖公章：为了确保协议的法律效力，双方应尽量在协议上加盖公章或合同专用章。
2. 完善签订手续：除了加盖公章外，双方还可以通过签字、按手印等方式进一步确认协议内容。
3. 保留证据：在协议签订和履行过程中，双方应保留好相关证据（如沟通记录、付款凭证等），以备不时之需。
4. 咨询专业人士：如果双方对协议的法律效力存在疑虑，建议咨询专业律师或法律机构，以获取更准确的法律意见。

综上所述，村代建协议无公章并不一定无效，但双方应尽量完善签订手续并保留好相关证据，以确保协议的法律效力。