当公司遭遇员工侵占财产并造成损失时，可以通过以下清晰且详细的步骤来索赔，以最大程度地维护公司的合法权益：
一、刑事附带民事诉讼途径
报案与立案：
- 公司应首先向公安机关报案，详细陈述员工侵占财产的事实，并提供相关证据，如账目记录、交易文件等。
- 公安机关在接到报案后，会进行立案侦查，确认是否存在职务侵占行为。
刑事附带民事诉讼：
- 若公安机关认定员工构成职务侵占罪，并提起刑事诉讼，公司作为被害人，可以同时提出附带民事诉讼。
- 在附带民事诉讼中，公司可以要求员工返还侵占的财物，并赔偿因侵占行为造成的直接和间接损失。
二、单独提起民事诉讼途径
准备证据：
- 若公司未选择刑事程序，或刑事程序结束后仍希望进一步索赔，可以单独提起民事诉讼。
- 在提起民事诉讼前，公司需要收集并整理相关证据，包括侵占行为的账目记录、交易文件、损失计算依据等。
提起诉讼：
- 公司可以依据《民法典》等相关法律规定，以不当得利或侵权为由，向法院起诉要求员工返还财产并赔偿损失。
- 赔偿范围应包括直接损失（如被侵占的财物价值）和间接损失（如因资金被侵占导致的经营停滞损失等）。
执行赔偿：
- 若员工被判刑入狱，其合法财产仍可用于执行赔偿。
- 公司可以通过法院强制执行程序，冻结、划拨员工的存款，拍卖、变卖其财物等，以实现债权。
三、内部调查与管理制度完善
内部调查：
- 在发现员工侵占财产后，公司应及时开展内部调查，固定相关证据，为后续法律程序做准备。
- 内部调查应全面、客观，确保收集到的证据真实、有效。
完善管理制度：
- 公司应完善内部管理制度，加强财务监管和人员监督，防止类似事件再次发生。
- 可以明确各岗位职责，规范工作流程，建立有效的内部控制机制。
四、注意事项与建议
- 证据收集：在整个索赔过程中，证据的收集与保存至关重要。公司应确保所有相关证据都得到妥善保管，以便在法律程序中提供有力支持。
- 法律咨询：由于法律程序复杂且专业性强，公司可以考虑聘请专业律师进行法律咨询和代理，以确保索赔过程的顺利进行。
- 及时行动：一旦发现员工侵占财产，公司应尽快采取行动，避免证据灭失或损失扩大。
综上所述，当公司遭遇员工侵占财产并造成损失时，可以通过刑事附带民事诉讼或单独提起民事诉讼的途径来索赔。同时，公司还应加强内部调查和管理制度完善，以防止类似事件再次发生。在整个过程中，公司应注重证据的收集与保存，并考虑聘请专业律师进行法律咨询和代理。