冷链物流中心改农贸市场是否违法违规，需分情况讨论，核心在于是否符合规划、审批及行业规范要求，具体分析如下：

1. 规划与土地用途层面
   若原冷链物流中心土地性质为工业用地或物流仓储用地，而农贸市场属于商业服务设施，直接改造可能违反《城乡规划法》及《土地管理法》。根据规定，土地用途变更需经自然资源部门审批，未履行变更手续擅自改造的，可能面临责令限期改正、罚款甚至强制拆除的风险。若原土地性质已明确包含商业服务功能（如综合用地），则改造行为可能合法。

2. 建筑安全与消防规范层面
   冷链物流中心与农贸市场在建筑结构、消防设计上存在差异。例如，冷链仓库可能采用封闭式结构，而农贸市场需满足通风、采光及疏散要求。若改造未重新申报消防验收或未达到《建筑设计防火规范》标准，可能违反《消防法》，导致停业整顿或行政处罚。

3. 行业准入与经营许可层面
   农贸市场经营需办理《市场登记证》《食品经营许可证》等专项许可，且需符合《农产品质量安全法》对场地卫生、检测设施的要求。若改造后未取得相关资质或未建立溯源体系，可能面临市场监管部门的查处。

4. 环保与卫生要求层面
   冷链物流中心若涉及制冷剂储存或危险化学品使用，改造为农贸市场前需完成环境影响评价（环评）及污染治理设施验收。若未履行环保手续或排放不达标，可能违反《环境保护法》及《大气污染防治法》。

建议行动：

• 立即核查原土地使用权证及规划许可证，确认土地性质及允许的用途范围；
  
• 委托专业机构对建筑结构、消防设施进行评估，确保符合农贸市场标准；
  
• 向市场监管、消防、环保等部门咨询具体审批流程，依法办理变更登记及许可；
  
• 若涉及集体土地，需额外确认是否符合《乡村振兴促进法》中关于产业用地转型的规定。
  

如有进一步细节（如土地性质、改造规模等），可直接向我咨询，我将结合具体情形提供法律风险评估及合规方案。