核心结论：做了受益人登记后公司股东发生变更，一般情况下受益人登记的效力不受直接影响，但需根据具体情况判断是否需要办理变更登记或采取其他措施，具体如下：

1. 受益人登记与股东变更的独立性 受益人登记通常是基于保险合同、信托合同或其他特定法律关系，明确特定主体在特定条件下的受益权。而公司股东变更属于公司股权结构的调整，涉及公司法范畴。二者在法律性质和调整对象上具有独立性，因此股东变更本身通常不会直接导致受益人登记失效或变更。

2. 需关注受益人身份与股东身份的关联性

   • 若受益人身份与股东身份无直接关联：例如受益人是基于保险合同指定的非股东自然人或法人，则股东变更不影响受益人登记的效力，无需额外处理。
   • 若受益人身份与股东身份存在关联：例如受益人是原股东本人或其关联方，且受益权与股东身份存在条件挂钩（如“股东在世时享有受益权”），则股东变更可能触发受益人登记的变更或终止。此时需根据合同条款或法律规定，判断是否需要重新办理受益人登记或调整受益权安排。

3. 合同条款的优先性 若受益人登记基于合同（如保险合同、信托合同），需优先审查合同中关于“股东变更对受益人影响”的条款。例如：

   • 合同明确约定“股东变更不影响受益人权利”，则无需额外处理；
   • 合同约定“受益人需为特定股东”，则股东变更后需按合同约定重新指定受益人或终止原登记。

4. 实务操作建议

   • 审查基础法律文件：核对受益人登记所依据的合同、公司章程或法律文件，明确受益权的具体条件及变更规则。
   • 评估变更必要性：若股东变更导致受益人身份或受益条件发生实质性变化，建议及时办理受益人变更登记，避免后续纠纷。
   • 留存书面证据：无论是否变更，均建议留存股东变更的工商登记文件、受益人登记文件及合同文本，以备查证。

提示：若涉及复杂法律关系（如跨境信托、保险金信托等），或合同条款存在争议，建议进一步提供具体文件细节，以便针对性分析。如有疑问，可直接向我咨询。