当公司的法人同时也是股东，并希望进行法人变更时，需要遵循一系列明确的步骤来确保变更的合法性和有效性。以下是一个详细且清晰的流程指南：

一、召开股东会

1. 会议召集：首先，需要召集所有股东召开股东会，讨论并决议变更法定代表人的事项。
2. 决议通过：股东会需作出变更法定代表人的决议，此决议需经代表三分之二以上表决权的股东通过才有效。
3. 明确新人选：决议中应明确新的法定代表人人选，并记录在案。

二、准备变更材料

1. 变更申请书：准备法定代表人变更申请书，详细说明变更原因及新人选情况。
2. 股东会决议：提供股东会通过的变更法定代表人的决议原件。
3. 公司章程修正案：根据公司法及股东会决议，修改公司章程中关于法定代表人的部分，并形成修正案。
4. 其他材料：根据当地工商行政管理部门的要求，可能还需提供其他相关材料，如法人的身份证明、公司的营业执照正副本等。

三、办理工商变更登记

1. 提交材料：将准备好的变更材料提交给当地工商行政管理部门，申请办理法定代表人变更登记。
2. 审核过程：工商部门会对提交的材料进行审核，确保其真实性和有效性。
3. 领取新执照：审核通过后，工商部门会颁发新的营业执照，上面会注明新的法定代表人信息。

四、税务等相关部门变更

1. 税务变更：法定代表人变更后，需及时到税务部门办理税务登记变更手续，确保公司税务信息的准确性。
2. 银行变更：同时，还需到公司开户银行办理银行信息变更手续，包括更新法定代表人信息、印鉴等。
3. 其他相关部门：根据公司业务需要，可能还需到其他相关部门（如社保、海关等）办理变更手续。

五、注意事项

1. 合规性：在整个变更过程中，应确保所有操作符合相关法律法规的要求，避免出现违规行为。
2. 时间规划：变更过程可能涉及多个部门和环节，建议提前做好时间规划，确保变更顺利进行。
3. 资料保管：变更完成后，应妥善保管所有相关文件和资料，以备后续需要。

综上所述，当法人同时也是股东并希望进行法人变更时，需要按照上述步骤进行操作。每一步都至关重要，确保变更的合法性和有效性。同时，也建议咨询专业律师或会计师的意见，以确保整个过程的顺利进行。