结论：因被诈骗立案3688元，5年后是否可以直接进行民事诉讼，需分情况讨论。

分析：

1. 刑事案件与民事诉讼的关系：

   • 诈骗案件通常首先由公安机关进行刑事立案侦查，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。
   • 在刑事案件处理过程中或处理完毕后，受害者有权就因诈骗行为遭受的财产损失提起民事诉讼，要求犯罪嫌疑人或相关责任人进行赔偿。

2. 诉讼时效问题：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
   • 在诈骗案件中，如果受害者在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内未提起民事诉讼，且没有诉讼时效中断或中止的情形，那么其民事诉讼权利可能会因超过诉讼时效而丧失。但需注意，刑事案件的立案、侦查、起诉、审判等过程可能会构成诉讼时效的中断或中止事由。
   • 针对您的情况，虽然诈骗案件已经立案5年，但并不意味着您已经丧失了提起民事诉讼的权利。关键在于判断这5年间是否存在诉讼时效中断或中止的情形，以及您是否在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内（考虑中断或中止后）提起了民事诉讼。

3. 直接进行民事诉讼的可能性：

   • 如果刑事案件已经处理完毕，且您未在诉讼时效期间内提起民事诉讼，但您认为存在诉讼时效中断或中止的情形（如一直在向犯罪嫌疑人或相关责任人主张权利、刑事案件处理过程中等），您可以尝试提起民事诉讼，并由法院根据具体情况判断诉讼时效是否已过。
   • 如果刑事案件尚未处理完毕，或者您确定在诉讼时效期间内（考虑中断或中止后）未提起民事诉讼，但您仍然希望就财产损失进行赔偿，您可以在刑事案件处理过程中或处理完毕后，及时提起民事诉讼。

建议：

• 收集证据：在提起民事诉讼前，务必收集好与诈骗案件相关的所有证据，包括转账记录、聊天记录、报警记录、刑事案件立案通知书等，以证明您的损失和犯罪嫌疑人的过错。
• 咨询律师：由于诉讼时效和民事诉讼程序涉及复杂的法律问题，建议您在提起民事诉讼前咨询专业律师，以评估您的诉讼风险和胜诉可能性。
• 及时行动：如果您决定提起民事诉讼，请务必在诉讼时效期间内（考虑中断或中止后）及时行动，以免丧失诉讼权利。

后续行动依据：

• 如果您决定提起民事诉讼，可以依据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，向有管辖权的人民法院提交起诉状和相关证据材料。
• 在诉讼过程中，您可以依据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的相关规定，要求犯罪嫌疑人或相关责任人承担赔偿责任。