结论：法院能否查封冻结肇事者家属作为公司出纳的银行卡中的公司资金，取决于该资金是否确实属于公司所有且未被个人财产混同，以及法院对案件具体情况的认定。
分析说明：
资金归属问题：
- 如果银行卡中的资金确实属于公司所有，且肇事者家属（出纳）能够清晰证明这些资金并非其个人财产，而是公司资产，那么法院在查封冻结时应当谨慎对待。因为根据法律规定，法院只能查封冻结属于被执行人（即肇事者或其家属，如果其被列为被执行人）的财产。
- 如果肇事者家属作为出纳，将个人财产与公司财产混同，或者无法清晰区分银行卡中的资金哪些属于公司、哪些属于个人，那么法院可能会根据案件具体情况，将银行卡中的全部或部分资金视为肇事者家属的财产进行查封冻结。
法院查封冻结的法律依据：
- 法院查封冻结财产的依据主要是《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律规定。根据这些规定，法院有权对被执行人的财产进行查封、冻结等强制执行措施，以保障债权人的合法权益。
- 在执行过程中，法院会审查被执行人的财产状况，包括银行账户、房产、车辆等。如果银行卡中的资金被认定为肇事者家属的财产，且符合查封冻结的条件，法院就会采取相应的措施。
实际操作中的考量：
- 在实际操作中，法院会要求肇事者家属提供银行卡的资金流水、公司财务报表等证据，以证明银行卡中的资金归属。如果肇事者家属无法提供充分证据，或者证据不足以证明资金归属，法院可能会倾向于将银行卡中的资金视为肇事者家属的财产进行查封冻结。
- 另外，如果肇事者家属作为公司出纳，存在挪用公司资金、侵占公司财产等违法行为，那么这些行为本身就可能构成犯罪，法院在查封冻结时也会考虑这些因素。
建议与行动：
对于肇事者家属（出纳）：
- 如果银行卡中的资金确实属于公司所有，应尽快整理相关证据，如银行转账记录、公司财务报表、工资单等，以证明资金归属。
- 如果存在个人财产与公司财产混同的情况，应尽快进行财产分割，避免被法院查封冻结个人财产。
- 如果认为法院的查封冻结行为存在错误或不当，可以依法向法院提出异议或申请复议。
对于公司：
- 应加强对公司财务的管理和监督，确保公司财产与个人财产严格分离。
- 如果发现出纳等财务人员存在违法行为或不当行为，应及时采取措施进行纠正和处理，并保留相关证据以备不时之需。
后续法律程序与风险：
- 如果法院查封冻结了银行卡中的资金，肇事者家属或公司可以依法向法院提出异议或申请复议，要求法院重新审查资金归属和查封冻结的合法性。
- 如果异议或复议被驳回，肇事者家属或公司还可以依法向上一级法院提起上诉或申请再审，以维护自己的合法权益。但需要注意的是，这些法律程序都需要耗费一定的时间和精力，且结果存在不确定性。因此，在采取法律行动前应充分评估风险和成本。
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