针对您提出的“不开行程单只开发票是否违法”的问题，我们可以从相关法律法规和实际操作的角度来详细分析。
首先，我们需要明确的是，不开发票（在此情境下，若行程单被视为购货凭证或服务单据的一种形式）是违法的。这一结论主要基于以下法律依据：
《中华人民共和国消费者权益保护法》第二十二条：该条款明确规定，经营者提供商品或者服务时，必须按照国家有关规定或商业惯例向消费者出具发票等购货凭证或服务单据。当消费者索要这些凭证时，经营者必须出具。这意味着，无论商家提供的是商品还是服务，都有义务向消费者提供相应的购货凭证或服务单据，发票是其中的一种重要形式。
《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定：该办法规定，销售商品、提供服务及从事其他经营活动的单位和个人，在对外发生经营业务收取款项后，应向付款方开具发票。若未按规定开具发票，如应当开具而未开具，税务机关将责令改正，并可处以罚款，甚至没收违法所得。
接下来，我们针对“不开行程单只开发票”这一具体情境进行分析：
行程单的性质：行程单通常被视为交通服务（如航空、铁路、公路等）的购货凭证或服务单据，它记录了消费者的行程信息、票价等关键数据。在某些情况下，行程单可能被视为发票的一种特殊形式，或者与发票具有同等的法律效力。但即便如此，如果消费者明确要求同时获得行程单和发票，商家也应尽量满足。
发票的开具要求：根据发票管理办法，商家在开具发票时，应确保项目齐全、字迹清楚、不得涂改，并加盖发票专用章。同时，发票应按照规定的时限、顺序，逐栏、全部联次一次性如实开具。这意味着，商家不能仅开具发票而忽略其他必要的购货凭证或服务单据（如行程单），除非消费者明确表示不需要。
实际操作中的合规性：在实际操作中，商家应遵循相关法律法规和商业惯例，根据消费者的需求提供相应的购货凭证或服务单据。如果消费者要求同时获得行程单和发票，商家应予以配合。如果商家仅开具发票而拒绝提供行程单，且没有合理的理由（如行程单已遗失、无法打印等），则可能构成违法行为。
结论与建议：
结论：不开行程单只开发票，在消费者明确要求同时获得行程单的情况下，可能构成违法行为。商家应严格遵守相关法律法规，根据消费者的需求提供相应的购货凭证或服务单据。
建议：作为消费者，在购买商品或接受服务时，应积极索要发票和其他必要的购货凭证或服务单据，以维护自己的合法权益。作为商家，应加强内部管理，确保合规开具发票和其他凭证，避免因违法行为而受到处罚。
希望以上分析能对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步的法律咨询，请随时告知。