祖辈留下的猪圈没有土地证，并不直接等同于违法，但可能存在一些法律风险和后续处理上的问题。以下从几个角度进行详细分析：

1. 土地证的法律意义：

   • 土地证是证明土地使用权归属的法定凭证。在农村地区，土地证（如宅基地使用权证）是确认土地归属和使用权的重要依据。
   • 没有土地证，可能意味着该猪圈所占用的土地没有明确的法律上的使用权归属，或者使用权归属存在争议。

2. 猪圈的历史使用情况：

   • 如果猪圈是祖辈长期使用，且历史上没有发生过土地权属争议，那么在实际操作中，可能仍然被视为合法使用。
   • 然而，这种历史使用情况并不能完全替代土地证的法律效力。在面临土地征收、拆迁或权属争议时，没有土地证可能会带来不利后果。

3. 可能的法律风险：

   • 权属争议：没有土地证，其他村民或集体组织可能对该土地提出权属主张，引发争议。
   • 行政处罚：在土地管理严格的情况下，没有土地证而占用土地可能被视为违法行为，面临行政处罚。
   • 拆迁补偿：在面临拆迁时，没有土地证可能影响拆迁补偿的获取。

4. 建议的处理方式：

   • 申请土地证：如果可能，应尽快向当地土地管理部门申请土地证，以明确土地使用权归属。
   • 协商解决：如果存在权属争议，可以尝试与相关方进行协商，达成一致意见后，再申请土地证或进行其他合法处理。
   • 法律途径：如果协商无果，且认为自己的权益受到侵害，可以通过法律途径维护自己的权益，如提起行政诉讼或民事诉讼。

5. 特殊情况考虑：

   • 如果猪圈所占用的土地属于集体所有，且集体组织对猪圈的使用没有异议，那么在实际操作中，可能仍然可以保持现状使用。
   • 但这种情况下，仍然建议尽快办理相关手续，以明确土地使用权归属，避免未来可能出现的法律风险。

总结来说，祖辈留下的猪圈没有土地证并不直接违法，但可能存在法律风险和后续处理上的问题。为了保障自己的权益，建议尽快申请土地证或采取其他合法措施明确土地使用权归属。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。