双方因打架立案后，若双方达成调解，一般可按以下方式处理：

1. 调解协议的达成与内容
   双方需在自愿、平等的基础上，就赔偿金额、道歉方式、后续责任承担等核心事项达成一致，并形成书面调解协议。协议内容应明确具体，例如：

   • 赔偿项目（医疗费、误工费、财产损失等）及金额；
     
   • 履行方式（一次性支付或分期支付）及期限；
     
   • 违约责任（如未按时履行需支付违约金）；
     
   • 双方承诺不再因此事追究对方责任。
     关键点：调解协议需双方签字确认，必要时可申请公证或由第三方（如居委会、派出所）见证，以增强法律效力。

2. 向公安机关提交调解协议
   双方需将调解协议提交至立案的公安机关（如派出所），由民警审核协议内容是否合法、合理。若公安机关认可协议，通常会根据《治安管理处罚法》第九条的规定，对案件作调解处理，不再对双方进行行政处罚（如罚款、拘留）。
   例外情形：若打架行为构成犯罪（如故意伤害罪致轻伤以上），公安机关需将案件移送检察院审查起诉，此时调解协议可能作为量刑情节（如从轻、减轻处罚），但无法直接终止刑事程序。

3. 调解协议的履行与监督
   调解协议生效后，双方应按约定履行义务。若一方拒不履行，另一方可：

   • 向法院提起民事诉讼，要求对方履行协议并赔偿损失；
     
   • 若涉及行政案件，可申请公安机关强制执行（但实践中公安机关通常不直接介入民事赔偿执行，需通过法院）；
     
   • 若涉及刑事案件，调解协议可作为被害人谅解的依据，影响量刑，但需通过检察院、法院程序处理。
     提示：建议履行过程中保留转账记录、收条等证据，以防纠纷。

4. 调解对案件结果的直接影响

   • 行政案件：调解成功且履行完毕的，公安机关一般不再处罚双方；
     
   • 刑事案件：调解协议（尤其是赔偿并取得谅解）可能使检察院作出不起诉决定，或法院判处缓刑、免予刑事处罚，但需结合具体情节（如伤害程度、主观恶性等）。
     

总结建议：调解是化解纠纷的有效方式，但需确保协议内容合法、履行到位。若对协议条款或法律后果有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您分析风险点。