占用农地15年可能涉及违法占用土地及土地承包经营权纠纷两类法律问题，需分情况处理，具体如下：
一、若占用行为未经合法审批，属于违法占用土地
法律定性
根据《土地管理法》第四条、第四十四条，农用地转为建设用地需依法办理农用地转用审批手续。未经批准占用农地15年，属于非法占用土地行为，可能同时违反《土地管理法》第七十七条（非法占地处罚）及《刑法》第三百四十二条（非法占用农用地罪，若造成耕地等农用地严重毁坏）。
处理方式
- 行政责任：自然资源主管部门可责令退还土地、限期拆除或没收地上建筑物，并处罚款（按占用面积每平方米100元至1000元标准）。
- 刑事责任：若占用基本农田5亩以上或一般耕地10亩以上，且造成种植条件严重毁坏，可能被追究刑事责任，处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金。
- 民事赔偿：土地权利人（如村集体或承包户）可要求返还土地、恢复原状或赔偿损失（如土地收益损失）。
二、若占用行为基于合法承包关系，但可能涉及合同纠纷
法律定性
根据《农村土地承包法》第二十一条，耕地承包期为30年。若占用者通过承包合同取得土地使用权，需审查合同期限及履行情况：
- 若合同未到期，占用者有权继续使用，但需按约定支付承包费；
- 若合同已到期未续签，占用者应返还土地，否则构成侵权。
处理方式
- 协商续签：双方可协商延长承包期，但需符合《农村土地承包法》第二十三条（承包方案需经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员同意）。
- 终止合同：若合同已到期且未续签，土地权利人可要求返还土地，并主张占用期间的土地收益损失（按当地同类土地平均收益计算）。
- 诉讼解决：若协商不成，可向法院提起民事诉讼，请求返还土地并赔偿损失。
三、特殊情形：历史遗留问题或政策性占用
若占用行为发生在特定历史时期（如改革开放初期）或基于政策性安排（如乡镇企业用地），需结合当时政策及地方性法规处理。例如：
- 政策性用地：若符合《土地管理法》第五十九条（乡镇企业用地审批条件），可补办审批手续；
- 历史遗留问题：若占用行为持续多年且未被查处，可能涉及“法不溯及既往”原则，需通过行政协调或司法程序明确责任。
建议行动：
- 立即核查占用行为的合法性（如是否取得审批、合同期限等）；
- 若涉及违法占地，尽快与自然资源部门沟通，争取从轻处理（如主动拆除违法建筑）；
- 若涉及合同纠纷，收集承包合同、缴费凭证等证据，通过协商或诉讼解决；
- 如有疑问，可进一步提供占用方式（如建房、耕种、经营等）、土地性质（如基本农田、一般耕地）等信息，以便更精准分析。