《中华人民共和国企业破产法》与《保障农民工工资支付条例》的效力不存在直接的高低之分，二者调整的法律关系和适用范围不同，在各自领域内具有同等法律效力。具体分析如下：

1. 法律效力层级相同
   两部法规均由国务院制定，属于行政法规范畴，在法律位阶上处于同一层级。根据《立法法》规定，行政法规的效力仅次于法律，高于地方性法规和部门规章。因此，从立法层级看，二者效力平等。

2. 调整对象与适用范围不同

   • 《企业破产法》：规范企业破产程序中的债务清偿、资产处置、债权人权益保护等法律关系，适用于所有具备破产原因的企业法人。
     
   • 《保障农民工工资支付条例》：专项保障农民工工资支付，明确用人单位责任、政府监管职责及工资清偿优先权，适用于工程建设领域及其他欠薪风险行业。
     结论：二者调整领域无交叉，不存在直接冲突，故无需比较效力高低。

3. 特殊情形下的适用规则
   若企业破产程序中涉及农民工工资清偿问题，需同时适用两部法规：

   • 根据《企业破产法》第113条，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，职工工资和社会保险费用属于第一顺位清偿范围；
     
   • 根据《保障农民工工资支付条例》第19条，农民工工资支付优先于其他债权，甚至可突破破产程序中的清偿顺序（需结合具体案情判断）。
     实践原则：在破产程序中，农民工工资清偿通常享有更高优先级，但需以符合《企业破产法》程序要求为前提。

建议：若您面临企业破产与农民工工资清偿的交叉问题，可进一步提供具体案情（如企业性质、欠薪金额、破产阶段等），我将结合两部法规及司法实践为您详细分析清偿方案。