结论：公司在员工拿到年终奖后提离职，一般情况下不能从工资中扣除年终奖，除非劳动合同或相关规章制度中有明确且合法的扣回条款，并且员工确实违反了相关约定。

分析说明：

1. 年终奖的性质：

   • 年终奖是员工薪酬的一部分，一旦发放，即成为员工的合法收入。它是对员工一年工作表现的奖励，与员工的劳动付出紧密相关。
   • 如果员工符合获得年终奖的条件，且公司发放年终奖的行为不存在错误，那么这笔钱就属于员工合法所得，公司无权无故扣回。

2. 劳动合同与规章制度的约定：

   • 劳动合同或公司规章制度中关于年终奖的约定，应当遵循法律程序制定并向员工公示才具有法律效力。这些约定可能包括年终奖的发放标准、时间、方式以及扣回条件等。
   • 如果劳动合同或规章制度中没有明确的扣回条款，或者扣回条款不合法（如违反法律法规、显失公平等），公司则无权扣回已发放的年终奖。

3. 特殊情况的考虑：

   • 在某些特殊情况下，如果劳动合同或规章制度中明确规定了员工需在一定期限内服务作为发放年终奖的条件，并且员工违反该约定提前离职，公司可能有权依据约定要求员工返还部分或全部年终奖。
   • 但这种情况必须基于双方的明确且合法的约定，并且公司需要提供充分的证据来证明员工确实违反了相关约定。例如，如果劳动合同中明确规定“员工需在公司服务满一年才能获得全额年终奖，若提前离职则按比例扣回”，且员工确实在未满一年的情况下离职，那么公司可能有权扣回部分年终奖。

4. 法律保障与维权途径：

   • 根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资，包括年终奖。
   • 如果公司擅自扣回已发放的年终奖，员工有权向劳动监察部门投诉，要求其责令公司限期支付工资差额，并可能加付赔偿金。
   • 员工还可以通过劳动仲裁甚至诉讼等法律途径来维护自己的合法权益，要求公司返还克扣的工资并主张相应的经济补偿。

建议措施：

• 员工在遇到此类问题时，应首先查阅自己的劳动合同、员工手册及公司的相关规章制度，了解是否有关于年终奖扣回的明确约定。
• 若无相关约定或约定不合法，员工应与公司进行友好沟通，要求其说明扣钱的原因，并指出这种做法的违法性。
• 若沟通无果，员工应及时收集相关证据，如劳动合同、工资条、年终奖发放记录等，通过法律手段来维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果公司擅自扣回年终奖且无法提供合法依据，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令限期支付工资差额、加付赔偿金等。
• 员工也可能通过法律途径获得经济补偿，包括返还被扣的年终奖以及可能的赔偿金。

综上所述，公司在员工拿到年终奖后提离职，一般情况下不能从工资中扣除年终奖。员工在遇到此类问题时，应了解自己的权益并采取合适的措施来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。