针对您提出的“项目经理签证单确定公司不认可怎么办”的问题，这通常涉及到公司内部管理流程或是对某些行政决定的异议。虽然直接的行业规范可能并未明确提及此类情况的处理方式，但我们可以借鉴一些通用的行政异议处理流程来为您提供建议。
首先，明确异议内容： 您需要明确公司不认可的具体内容是什么，是签证单上的某些条款、金额、还是整个签证单的有效性。明确这一点后，您可以更有针对性地准备后续的申诉材料。
接下来，收集证据材料： 为了支持您的异议，您需要收集相关的证据材料。这可能包括但不限于：
然后，与公司内部沟通： 在正式提出异议之前，建议您先与公司内部的相关部门或负责人进行沟通，了解他们不认可的具体原因，并尝试通过协商解决问题。如果沟通无果，您可以再考虑采取更正式的异议申诉流程。
若涉及行政决定或外部机构： 如果签证单的不认可涉及到外部行政机构或第三方的决定，您可以参考以下行政异议处理流程：
了解相关法律法规： 查阅与签证单相关的法律法规，了解您的权益和可能的救济途径。例如，如果签证单与建筑许可、行政处罚等有关，您可以查阅《中华人民共和国行政复议法》、《中华人民共和国行政诉讼法》等相关法律。
提出异议申诉： 根据相关法律法规的规定，向作出决定的行政机构或相关部门提出异议申诉。在申诉时，您需要提交详细的申诉材料，包括异议内容、证据材料、相关法律法规依据等。
等待处理结果： 行政机构或相关部门在收到您的异议申诉后，会进行初步核实，并根据提交的材料进行进一步调查。在规定的时间内，他们会给出处理结果，并告知您是否更正相关决定或提供其他救济途径。
寻求法律救济： 如果您对处理结果不满意，还可以根据相关法律法规的规定，向行政复议机关提出行政复议申请，或者向人民法院提起行政诉讼。
最后，保持耐心和理性： 在整个异议处理过程中，保持耐心和理性是非常重要的。与公司和相关机构保持良好沟通，积极配合调查和处理工作，有助于更快地解决问题。
希望以上建议能对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何具体问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。