针对您提出的“多年不在家，原有房子被乡镇府说规划为基本农田，该如何处理”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：

一、了解基本农田的定义与保护规定

首先，您需要明确基本农田的定义。根据相关法律及政策规定，基本农田是指中国按照一定时期人口和社会经济发展对农产品的需求，依据土地利用总体规划确定的长期不得占用的耕地。它受到严格的保护，禁止任何单位和个人在基本农田保护区内进行建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动。

二、核实乡镇府规划的合法性

1. 查询规划文件：您可以向乡镇府或当地自然资源部门查询相关规划文件，了解您的房子是否确实被规划为基本农田，以及这一规划是否经过了合法的审批程序。

2. 了解规划依据：询问规划的依据是什么，是否符合当地的土地利用总体规划和村庄规划。如果规划缺乏合法依据或违反了相关规划，您可以提出异议。

三、处理方式与建议

1. 协商解决：

   • 如果您的房子确实被错误地规划为基本农田，您可以与乡镇府进行协商，要求他们重新核实并调整规划。
   • 提供您的宅基地证、房屋照片等相关证据，证明您的房子原本就存在，并非后来非法占用耕地建设的。

2. 申请复核：

   • 如果协商无果，您可以向当地自然资源部门或上级政府申请复核，要求他们对规划进行重新审查。
   • 在申请复核时，提供详细的证据和理由，说明规划的不合理性和对您的影响。

3. 法律途径：

   • 如果复核结果仍然对您不利，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 咨询专业律师，了解您的法律权利和可能的诉讼途径。根据《中华人民共和国刑法》和《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定》，非法占用基本农田五亩以上或者基本农田以外的耕地十亩以上的，将受到法律制裁。但这一条款主要是针对非法占用行为，对于您这种情况，更可能是通过行政诉讼来维护权益。

4. 关注政策动态：

   • 密切关注当地关于耕地保护和宅基地管理的政策动态，了解是否有新的政策出台或调整，可能为您的情况带来转机。

四、预防措施与建议

1. 定期回家查看：

   • 如果您长期不在家，建议定期回家查看房屋和土地情况，及时发现并处理问题。

2. 与邻居保持联系：

   • 与邻居保持联系，了解当地的情况和政策变化，以便及时采取措施。

3. 保留相关证据：

   • 保留好宅基地证、房屋照片等相关证据，以备不时之需。

综上所述，面对乡镇府将您的原有房子规划为基本农田的情况，您可以通过协商、申请复核、法律途径等方式来维护自己的权益。同时，也建议您密切关注政策动态，采取预防措施，以避免类似问题的再次发生。希望这些建议能对您有所帮助。