在勘察单位与设计总承包单位签订的勘察分包合同中，勘察的主体责任主要由勘察单位承担。以下是对这一问题的详细分析：
一、合同关系与责任主体
合同关系：
- 勘察单位与设计总承包单位签订的是勘察分包合同，这意味着勘察单位是作为分包方，根据设计总承包单位的要求进行勘察工作。
- 设计总承包单位则作为总包方，对整体工程的设计、勘察、施工等环节负有总责，但在具体的勘察工作中，其责任会通过分包合同转移给勘察单位。
责任主体：
- 根据合同相对性原则，勘察单位作为勘察分包合同的直接当事人，应当对其提供的勘察成果负责。
- 设计总承包单位虽然对整体工程负有总责，但在勘察环节，其责任主要体现在对勘察单位的选任、监督和管理上，而非直接承担勘察工作的主体责任。
二、勘察单位的责任内容
按时提交勘察文件：
- 勘察单位必须严格按照合同约定的期限提交勘察成果文件，这是其基础责任之一。
- 逾期提交或提交的勘察成果不符合合同要求，勘察单位需承担相应的违约责任。
保证勘察成果质量：
- 勘察单位应按照国家和地方的相关法律法规、技术标准、规范等强制性要求开展勘察工作。
- 提交的勘察成果资料必须真实、准确、完整，满足设计、施工等后续工程建设阶段的需要。
- 若勘察成果质量不合格，勘察单位需负责无偿补充完善，并承担因勘察质量造成的经济损失和工程事故责任。
配合施工与协作：
- 在工程建设过程中，勘察单位有义务与设计、施工等单位进行紧密协作。
- 提供必要的解释和技术咨询服务，确保勘察成果能够顺利应用于工程建设中。
保密与安全环保责任：
- 勘察单位对在勘察过程中知悉的商业秘密、技术秘密以及工程相关的其他秘密负有保密义务。
- 负责勘察现场的安全管理工作，制定并实施有效的安全措施。
- 遵守环境保护法律法规，采取有效措施减少对周边环境的影响。
三、设计总承包单位的监督与管理责任
选任责任：
- 设计总承包单位在选择勘察单位时，应确保其具备相应的资质和能力。
- 若因选任不当导致勘察工作出现问题，设计总承包单位需承担相应的选任责任。
监督与管理责任：
- 设计总承包单位应对勘察单位的勘察工作进行监督和管理。
- 确保勘察单位按照合同约定和法律法规要求开展勘察工作。
- 若因监督不力导致勘察工作出现问题，设计总承包单位也需承担相应的管理责任。
四、法律后果与争议解决
法律后果：
- 若勘察单位未履行其主体责任，导致勘察成果质量不合格或造成其他损失，其需承担相应的法律责任。
- 设计总承包单位若未履行其监督与管理责任，也可能需承担相应的法律责任。
争议解决：
- 在合同履行过程中，若双方发生争议，应首先通过协商解决。
- 协商不成的，可以根据合同约定或法律规定，通过仲裁或诉讼等方式解决争议。
总结与建议：
在勘察单位与设计总承包单位签订的勘察分包合同中，勘察单位作为勘察工作的直接执行者，承担着主要的主体责任。设计总承包单位则对勘察单位负有选任、监督和管理责任。为确保合同的顺利履行和工程项目的顺利进行，双方应严格遵守相关法律法规和合同条款，明确各自的责任和义务。若在实际操作中遇到任何问题或争议，建议及时咨询专业律师以获取针对性的法律建议。