法院在特定情况下要求与案件无关的公司提交财务资料是合法的，但需满足严格的法律条件和程序要求。以下从不同角度详细分析这一问题：

1. 法律依据与程序要求

• 法院调查权：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条，法院有权向有关单位和个人调查取证，相关单位和个人不得拒绝。这一条款为法院要求第三方（包括与案件无关的公司）提供资料提供了法律依据。
• 程序合法性：法院要求提交资料时，通常会发出正式的调查令或协助执行通知书，明确要求提交的资料范围、目的和期限。被要求的公司需在收到通知后，按照要求提供资料，否则可能面临罚款等法律后果。

2. “与案件无关”的界定

• 关联性原则：虽然公司本身可能与案件无直接法律关系，但若其持有的资料对案件事实的查明具有关键作用（如涉及资金流向、交易记录等），法院仍可要求其提交。
• 例外情形：若资料完全无关（如公司内部管理文件、与案件无关的财务记录等），公司可提出异议，法院需审查后决定是否采纳。

3. 公司的权利与义务

• 配合义务：作为第三方，公司有义务配合法院的调查工作，提供与案件相关的资料。这是公民和法人对司法活动的法定义务。
• 异议权：若公司认为法院要求提交的资料超出必要范围或侵犯其合法权益（如商业秘密），可向法院提出书面异议，并说明理由。法院需审查后作出决定。
• 保密义务：法院和公司在处理提交的资料时，均需遵守保密规定，防止资料泄露或被不当使用。

4. 可能的法律后果

• 拒不配合的后果：若公司无正当理由拒不提交资料，法院可依据《民事诉讼法》第一百一十四条，对其处以罚款（个人为十万元以下，单位为五万元以上一百万元以下），并可向其上级机关或监察机关提出司法建议。
• 资料泄露的责任：若因法院或公司原因导致资料泄露，造成损失的，相关责任方需承担赔偿责任。

5. 实务建议

• 公司角度：收到法院通知后，应首先审查资料范围与案件的关联性。若认为无关，及时提出异议；若有关，则按要求提交，并保留提交记录。
• 法院角度：应严格限定调查范围，避免过度干预第三方正常经营。同时，加强对提交资料的保密管理，防止泄露。

总结：法院要求与案件无关的公司提交财务资料，在符合法律条件和程序要求的前提下是合法的。公司应积极配合，但也有权对超出必要范围的调查提出异议。若遇到此类问题，建议及时咨询专业律师，确保合法权益不受侵害。