结论：挂靠公司提成后公司法人再提成是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断，包括挂靠协议的约定、公司章程规定、是否违反法律法规强制性规定等。以下从不同角度进行分析：
一、从挂靠协议角度分析
若挂靠协议有明确约定：
- 如果挂靠协议中明确规定了挂靠方应支付给被挂靠公司的提成比例，以及被挂靠公司法人是否有权在挂靠公司提成基础上再进行提成，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么按照协议约定执行是合法的。
- 例如，挂靠协议中约定挂靠方需支付给被挂靠公司10%的提成，同时被挂靠公司法人有权在挂靠公司提成基础上再提取2%作为管理费，且该约定符合相关法律法规，那么这种提成方式就是合法的。
若挂靠协议无明确约定：
- 如果挂靠协议中没有明确规定被挂靠公司法人是否有权在挂靠公司提成基础上再进行提成，那么这种提成方式可能缺乏合同依据，容易引发纠纷。
- 在此情况下，被挂靠公司法人单方面要求再提成可能构成对挂靠方权益的侵害，挂靠方有权拒绝并寻求法律途径维护自身权益。
二、从公司章程和内部管理规定角度分析
若公司章程或内部管理规定有明确规定：
- 如果被挂靠公司的公司章程或内部管理规定中明确规定了公司法人有权在挂靠公司提成基础上再进行提成，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么这种提成方式在公司内部是合法的。
- 但需要注意的是，公司章程或内部管理规定不能对抗外部挂靠方的合法权益，如果挂靠方对此提出异议，仍需通过协商或法律途径解决。
若公司章程或内部管理规定无明确规定：
- 如果公司章程或内部管理规定中没有明确规定公司法人是否有权在挂靠公司提成基础上再进行提成，那么这种提成方式可能缺乏公司内部依据，容易引发公司内部争议。
- 在此情况下，公司法人单方面要求再提成可能缺乏合法性支持，公司内部其他股东或管理层有权提出异议并寻求解决方案。
三、从法律法规角度分析
遵守相关法律法规：
- 无论挂靠协议、公司章程还是内部管理规定如何约定，都必须遵守国家相关法律法规的强制性规定。
- 如果被挂靠公司法人的提成行为违反了税收法规、反不正当竞争法等相关法律法规的强制性规定，那么这种提成方式就是违法的，将受到法律的制裁。
避免利益输送和腐败：
- 在挂靠关系中，应避免出现利益输送和腐败现象。如果被挂靠公司法人的提成行为被认定为利益输送或腐败行为，那么不仅这种提成方式违法，相关责任人还将承担法律责任。
法律建议
明确约定提成方式：
- 在签订挂靠协议时，应明确约定提成方式、比例和支付方式等关键条款，以避免后续纠纷。
遵守公司章程和内部管理规定：
- 被挂靠公司应制定完善的公司章程和内部管理规定，明确公司法人的职权和提成方式等关键事项，以确保公司运营的合法性和规范性。
遵守法律法规：
- 在进行提成行为时，必须遵守国家相关法律法规的强制性规定，避免出现违法违规行为。
寻求法律帮助：
- 如果对提成方式的合法性存在疑问或遇到相关纠纷，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助和支持。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。