针对“耕种40年的非耕地怎么处理”这一问题，核心在于明确土地性质、权属及耕种行为的法律性质，以下是具体分析：
确认土地性质与权属
首先需明确该土地是否属于“非耕地”范畴（如林地、草地、未利用地等），以及是否已被纳入国土空间规划中的建设用地、生态保护红线等。若土地性质为集体所有，需确认是否已依法分配给集体成员使用，或是否存在权属争议。若土地权属清晰且未被征收为国有，耕种行为本身不直接改变土地性质，但需注意是否违反土地管理法规。
耕种行为的合法性分析
- 合法情形：若耕种行为经集体经济组织同意（如承包、流转），或符合“四荒地”（荒山、荒沟、荒丘、荒滩）开发政策，且未破坏生态或违反规划，可能被认定为合法使用。此时可主张继续使用，但需补办相关手续（如承包合同、土地经营权登记）。
- 违法情形：若未经许可擅自开垦未利用地，或改变林地、草地用途为耕地，可能违反《土地管理法》《森林法》《草原法》等规定，面临责令退还、恢复原状、罚款等处罚。若已耕种40年，可主张历史使用事实，但需结合当地政策及行政机关的认定。
特殊政策与历史遗留问题处理
- “二轮承包”延包政策：若该土地在第二轮土地承包中已被纳入承包范围，即使原为非耕地，也可依据《农村土地承包法》主张承包权延续。
- “三权分置”改革：若土地已流转，可依据流转合同主张土地经营权，但需确保合同不违反法律强制性规定（如不得改变农业用途）。
- 历史遗留问题：部分地区对长期耕种未利用地的行为，可能通过地方政策予以确权或补偿（如“四荒地”拍卖、租赁），需结合当地具体规定。
建议行动步骤
- 查询土地权属与规划：向当地自然资源部门申请信息公开，确认土地性质、权属及规划用途。
- 补办手续或协商确权：若耕种行为合法但未登记，可与集体经济组织协商补签承包合同或流转协议，并办理土地经营权登记。
- 应对行政处罚：若面临处罚，可主张“历史使用事实”“未造成严重后果”等情节，申请从轻或免除处罚，或通过行政复议、诉讼途径维权。
- 关注政策动态：部分地区对长期耕种非耕地的行为有特殊补偿政策（如生态补偿、土地整治项目），可主动咨询当地农业农村部门。
总结：耕种40年的非耕地处理需结合土地性质、权属、耕种合法性及地方政策综合判断。建议优先确认土地权属与规划，再根据具体情况补办手续、协商确权或应对处罚。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。