法院在违法建设又侵权的情况下，确实可以直接判决违法建设拆除，但这并非绝对，需根据具体情况综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
违法建设的认定与处理原则
- 违法建设，通常指的是违反城乡规划、土地管理等相关法律法规，未经批准或未按批准内容建设的建筑物、构筑物等。对于违法建设，行政机关有权依法进行查处，包括责令停止建设、限期改正、罚款、没收违法所得或违法建筑物等，甚至在特定情况下，可以强制拆除。
- 在司法程序中，如果违法建设同时侵犯了他人的合法权益（如相邻权、土地使用权等），受害人可以向法院提起民事诉讼，要求停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。在诉讼过程中，如果法院认定违法建设确实存在且构成侵权，有权根据受害人的请求，判决违法建设拆除。
法院判决拆除违法建设的条件
- 违法性明确：法院需确认建设行为确实违反了相关法律法规，且该违法性不因其他因素（如时间久远、已缴纳罚款等）而消除。
- 侵权事实成立：需证明违法建设对受害人的合法权益造成了实际侵害，如遮挡阳光、影响通风、占用公共空间等。
- 拆除的必要性：法院会综合考虑拆除违法建设对公共利益、他人合法权益的影响，以及是否存在其他更合理的救济方式（如赔偿损失、调整建设方案等）。如果拆除是唯一或最合理的救济方式，法院更可能判决拆除。
特殊情况下的处理
- 历史遗留问题：对于一些历史遗留的违法建设，如果拆除可能引发更大的社会矛盾或不稳定因素，法院可能会采取更为谨慎的态度，寻求其他解决方案。
- 行政程序优先：在某些情况下，如果行政机关已经对违法建设启动了查处程序，法院可能会建议或要求当事人先通过行政程序解决，以避免司法与行政的冲突。
法律后果与执行
- 如果法院判决拆除违法建设，建设方或相关责任人需在规定期限内自行拆除。逾期不拆除的，法院可以依法强制执行，包括委托第三方拆除、罚款等措施。
- 拆除过程中，需确保安全、环保等要求，避免对周边环境和他人造成不必要的损害。
建议：如果您面临违法建设侵权的问题，建议首先收集相关证据（如照片、视频、规划图纸、行政处罚决定书等），以证明违法建设的存在和侵权事实。然后，您可以向法院提起民事诉讼，要求停止侵害、排除妨碍或赔偿损失等。在诉讼过程中，法院会根据具体情况判断是否判决拆除违法建设。如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。