结论前置：当因非自有资金导致主合同无效，进而使得担保合同无效时，担保人的责任取决于其是否存在过错。若担保人无过错，则通常不承担责任；若有过错，则需根据其过错程度承担相应的民事责任，但一般不超过债务人不能清偿部分的三分之一。
一、担保合同无效的法律基础
根据《民法典》第三百八十八条，担保合同是主债权债务合同的从合同。主债权债务合同无效的，担保合同无效，但法律另有规定的除外。这意味着，主合同的效力直接影响到担保合同的效力。当主合同因非自有资金等原因无效时，担保合同也随之无效。
二、担保人责任的具体判定
担保人无过错的情况：
- 如果担保人对主合同的无效状态不存在过错，例如因主合同双方恶意串通骗取担保，或债权人的重大过错导致主合同无效，且担保人在整个过程中毫不知情且无促成无效行为，则担保人不承担民事责任。
担保人有过错的情况：
- 当担保人明知主合同存在无效因素仍提供担保，或因自身疏忽、违规等行为对主合同无效起到推动作用时，需承担过错责任。具体责任范围通常不超过债务人不能清偿部分的三分之一。例如，如果债务人欠款100万元无法偿还，且担保人存在一定过错，那么其承担的赔偿责任最多为约33.33万元（100万元×1/3）。
担保人与债务人共同过错的情况：
- 如果担保人与债务人对主合同无效均有过错，且双方的过错程度相当或者难以明确区分主次，那么担保人可能需要承担更高的责任比例，但一般也不超过债务人不能清偿部分的二分之一。
三、实务操作中的风险防范建议
对担保人的建议：
- 谨慎审查主合同：在提供担保前，应仔细审查主合同的内容，确保其合法性和有效性。特别是要关注主合同中的资金来源、用途等关键条款，以避免因主合同无效而卷入不必要的法律纠纷。
- 明确约定担保条款：在担保合同中明确约定担保人的责任范围和免责条款，以减少潜在的法律风险。例如，可以约定在主合同无效的情况下，担保人仅承担有限的责任或完全不承担责任。
- 加强履约管理：在担保期间，应定期跟踪主合同的履行情况，及时发现并处理可能影响担保合同效力的问题。
对债权人的建议：
- 加强尽职调查：在签订主合同前，应对债务人的资信状况、还款能力等进行充分的调查和评估，以确保主合同的合法性和有效性。
- 优化担保结构设计：可以采用组合担保方式分散风险，例如同时要求债务人提供抵押、质押和保证等多种担保方式。
- 及时行使权利：在主合同纠纷发生后，应及时主张担保权利，避免因时效问题而丧失追索权。
四、具体案例参考
假设某银行向一家无资质的房地产开发企业提供贷款，并要求一家担保公司提供保证。后因该房地产开发企业使用非自有资金进行开发，导致主合同无效。在此情况下，如果担保公司在提供担保时未尽审查义务，未发现该企业的资质问题，那么担保公司可能需要承担一定的赔偿责任。法院最终可能根据担保公司的过错程度，判决其承担债务人不能清偿部分的一定比例（如25%）的赔偿责任。
总结：因非自有资金导致主合同无效进而使得担保合同无效时，担保人的责任取决于其是否存在过错。为了降低法律风险，担保人和债权人都应加强尽职调查、明确约定合同条款并加强履约管理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。