结论：针对您拆迁协议上两套安置房，已卖出一套后，安置协议和选房卡的处理问题，我建议您根据以下不同情况来妥善处理。

1. 安置协议的处理

• 保留原件：首先，无论您是否已经卖出一套安置房，原始的拆迁安置协议都是非常重要的法律文件，它证明了您与拆迁方之间的权利和义务关系。因此，您必须妥善保管好安置协议的原件，以备后续可能出现的任何法律纠纷或需要证明您权益的情况。

• 复印件使用：在卖出其中一套安置房的过程中，您可能需要向买方或相关部门提供安置协议的复印件。在提供复印件时，建议您在复印件上注明“此复印件仅用于XX用途，与原件一致，再次复印无效”等字样，并签字确认，以防止复印件被滥用。

2. 选房卡的处理

• 已售房屋的选房卡：对于已经卖出的那套安置房的选房卡，您应该将其交给买方。因为选房卡是选房和办理后续入住手续的重要凭证，买方需要它来完成购房流程。在交付选房卡时，建议您与买方签订一份书面协议，明确选房卡的交付时间、方式以及双方的权利和义务，以避免后续纠纷。

• 未售房屋的选房卡：对于尚未售出的那套安置房的选房卡，您应该继续妥善保管。在您决定出售或自行入住时，该选房卡将是您办理相关手续的重要依据。

3. 后续注意事项

• 及时办理过户手续：如果您已经卖出了其中一套安置房，务必及时与买方办理房屋过户手续。过户是房屋所有权转移的法律程序，只有完成过户，买方才能真正成为房屋的合法所有者。

• 关注政策变化：拆迁安置政策可能会因地区和时间的不同而有所变化。建议您密切关注相关政策动态，以确保您的权益不受影响。例如，如果政策对安置房的出售有新的规定或限制，您需要及时了解并遵守。

• 保留相关证据：在处理安置协议和选房卡的过程中，建议您保留好所有相关的证据和文件，如交易合同、付款凭证、交付记录等。这些证据和文件将在后续可能出现的法律纠纷中发挥重要作用。

如果您在处理过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况和当地法律法规，为您提供专业的法律建议和帮助。