针对您提出的“摩托车被扣没有合格证和发票怎么处理”的问题，虽然提供的参考信息主要是关于电动自行车上牌的容缺办理政策，但我们可以借鉴其中的思路，结合摩托车管理的实际情况，给出以下建议：

一、了解当地政策

首先，您需要了解当地交通管理部门对于摩托车被扣且缺失合格证和发票的具体处理政策。不同地区可能有不同的规定，有的地方可能提供类似的“容缺办理”服务，允许车主在缺失某些材料的情况下，通过其他方式证明车辆来源和合法性，从而完成相关手续。

二、准备替代材料

如果当地政策允许容缺办理，您可能需要准备以下替代材料：

1. 身份证明：车主本人的身份证，如果是非本地户籍，可能还需要提供居住证或其他相关证明。

2. 购车证明：

   • 如果缺失购车发票，可以尝试联系销售商，看是否能补开或提供加盖公章的购车收据。
   • 如果销售商无法提供，您可以考虑撰写一份购车情况说明，详细描述购车时间、地点、车辆信息等，并附上销售商的联系方式（如果可能的话），以便交通管理部门核实。

3. 车辆合格证替代材料：

   • 如果缺失车辆合格证，您可以尝试联系车辆制造商或销售商，看是否能补发或提供车辆合格证的复印件或电子版。
   • 如果无法获得，您可能需要提供车辆的其他证明文件，如车辆出厂合格证明（如果有的话）、车辆一致性证书等。

4. 容缺办理声明书：

   • 类似于电动自行车上牌中的《容缺办理声明书》，您可以撰写一份声明，说明由于何种原因缺失了合格证和发票，并承诺车辆来源合法、未涉及盗抢等违法行为。这份声明可能需要您签字并按手印，以增加其法律效力。

三、前往交通管理部门办理

备齐上述材料后，您需要前往当地交通管理部门（如交警大队、车管所等）进行办理。在办理过程中，您可能需要：

1. 填写相关申请表格，提供个人信息和车辆信息。

2. 提交上述准备好的替代材料。

3. 配合交通管理部门进行车辆查验，确认车辆信息与提交的材料一致。

4. 缴纳相关费用（如罚款、工本费等）。

5. 等待审核结果，如果审核通过，您将获得车辆的相关手续或放行通知。

四、注意事项

1. 保持沟通：在办理过程中，与交通管理部门保持密切沟通，及时了解办理进度和需要补充的材料。

2. 合法合规：确保提供的所有材料真实有效，不伪造、不篡改。如果车辆确实存在违法问题（如盗抢、拼装等），应主动配合交通管理部门进行处理。

3. 预防措施：为了避免类似情况再次发生，建议您在购车时妥善保管好合格证和发票等重要文件，并考虑将电子版备份在云端或安全存储设备中。

希望以上建议能对您有所帮助。如果当地政策有特殊规定或您需要更具体的指导，请直接咨询当地交通管理部门或相关法律服务机构。