结论前置：农民工工资三个月没发是违法的。
法律背景与解释：
法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，用人单位有义务按月支付劳动者的工资，不得无故拖欠。
拖欠工资的违法性：
- 当农民工的工资被拖欠三个月时，这明显违反了上述法律规定。用人单位的行为构成了无故拖欠工资，是违法的。
法律后果：
- 对于拖欠工资的行为，劳动者有权向劳动行政部门投诉，劳动行政部门应当依法处理，责令用人单位支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。
- 如果用人单位拒不支付，劳动者还可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
法律建议：
收集证据：
- 农民工在遭遇拖欠工资时，应首先收集相关证据，如工资条、劳动合同、工作记录等，以证明自己的劳动关系和工资情况。
与用人单位协商：
- 在收集到足够证据后，可以尝试与用人单位进行协商，要求其支付拖欠的工资。如果协商无果，再考虑采取其他法律手段。
向劳动行政部门投诉：
- 如果协商无果，农民工可以向当地的劳动行政部门投诉，请求其介入处理。劳动行政部门有权对用人单位进行调查，并责令其支付拖欠的工资。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果劳动行政部门的处理未能满足农民工的诉求，他们还可以向劳动仲裁机构申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。
特殊情况说明：
- 在某些特殊情况下，如用人单位因经营困难等暂时无法支付工资，且能够证明其并非恶意拖欠，那么可能不构成违法。但即便如此，用人单位也应与劳动者协商，并尽快支付工资，以避免引发不必要的法律纠纷。
总结与提醒：
农民工工资三个月没发是违法的，农民工有权通过法律途径来维护自己的合法权益。在遭遇拖欠工资时，农民工应保持冷静，收集证据，并尝试与用人单位协商。如果协商无果，应及时向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁、提起诉讼。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。