当用人单位对劳动能力鉴定委员会作出的伤残等级鉴定结论存在异议时，可以依据相关法律法规，通过合法途径来提出异议并寻求解决。以下是一个详细且清晰的解答流程：

一、申请再次鉴定

适用情形： 如果用人单位对设区的市级劳动能力鉴定委员会作出的初次鉴定结论不服，可以申请再次鉴定。

法律依据： 根据《工伤保险条例》第二十六条，用人单位在收到初次鉴定结论之日起15日内，有权向省、自治区、直辖市劳动能力鉴定委员会提出再次鉴定申请。

操作流程：

1. 准备材料：

   • 再次鉴定申请书
   • 初次劳动能力鉴定结论书原件及复印件
   • 被鉴定人身份证复印件
   • 相关医疗诊断证明
   • 工伤事故调查报告（如有）

2. 提交申请：

   • 将准备好的材料提交给省、自治区、直辖市劳动能力鉴定委员会。

3. 等待鉴定：

   • 省级劳动能力鉴定委员会将重新组织专家进行鉴定，其作出的鉴定结论为最终结论，用人单位需接受。

二、申请复查鉴定（如适用）

适用情形： 如果自劳动能力鉴定结论作出之日起1年后，用人单位认为工伤职工的伤残情况发生了变化，可以申请复查鉴定。

法律依据： 根据《工伤保险条例》第二十八条，用人单位需向劳动能力鉴定委员会提出复查鉴定申请，并说明理由和依据。

操作流程：

1. 准备材料：

   • 复查鉴定申请书
   • 初次或上次劳动能力鉴定结论书原件及复印件
   • 新的医疗诊断证明或相关证据材料

2. 提交申请：

   • 将准备好的材料提交给劳动能力鉴定委员会。

3. 等待鉴定：

   • 劳动能力鉴定委员会审核后，符合条件的将安排复查鉴定。

三、注意事项

1. 时间限制：

   • 无论是申请再次鉴定还是复查鉴定，都有严格的时间限制。用人单位必须及时行动，以免错过维权机会。

2. 材料准备：

   • 提交异议申请时，应准备充分的相关证明材料，以支持自己的观点和诉求。这些材料应真实、完整、有效。

3. 尊重最终结论：

   • 省级劳动能力鉴定委员会作出的鉴定结论为最终结论，用人单位需尊重并接受。如果仍有异议，但无法通过法律途径进一步解决，应考虑通过协商或其他方式处理。

四、特殊情况下的救济手段

如果用人单位认为鉴定过程中存在程序违法（如鉴定人员与当事人有利害关系未回避、认定机构无管辖权等），且该行为可被认定为具体行政行为时，可以考虑通过行政复议或行政诉讼途径解决。但这种情况相对特殊，且需要充分的证据支持。

行政复议：

• 用人单位应自知道具体行政行为之日起60日内提出复议申请（法律另有规定的除外）。
• 复议机关一般为同级人民政府或上一级主管部门。

行政诉讼：

• 如果对行政复议结果不满或直接选择此途径，用人单位应在知道或应当知道作出行政行为之日起6个月内提起诉讼（法律另有规定的除外）。

综上所述，当用人单位对劳动能力鉴定委员会的伤残等级鉴定结论有异议时，应首先尝试申请再次鉴定或复查鉴定（如适用）。在整个过程中，要严格遵守相关规定和程序要求，并准备好充分的证据材料以支持自己的主张。如果涉及程序违法问题且证据充分，可以考虑申请行政复议或提起行政诉讼。