在机动车与非机动车发生交通事故，且非机动车被认定为次要责任的情况下，保险公司的赔偿流程通常遵循以下详细步骤和原则：
一、责任划分与保险类型确认
责任划分：
- 根据交警部门出具的事故认定书，明确机动车和非机动车各自的责任比例。在主次责任划分中，机动车通常承担70%至80%的责任，非机动车则承担20%至30%的责任，具体比例以事故认定书为准。
保险类型：
- 交强险：这是机动车必须投保的强制保险，用于赔偿第三方（包括非机动车）的人身伤亡和财产损失。在有责情况下，交强险的死亡伤残赔偿限额为18万元，医疗费用赔偿限额为1.8万元，财产损失赔偿限额为0.2万元。
- 商业险：如第三者责任险等，是机动车可自愿投保的险种，用于补充交强险赔偿不足的部分。
二、理赔流程
报案：
- 事故发生后，机动车方应及时向保险公司报案，提供事故时间、地点、经过等详细信息，并保留现场照片、视频等证据。
定损与核赔：
- 保险公司会派员到现场查勘，评估损失情况，包括非机动车方的人身伤亡和财产损失。
- 根据事故认定书和责任比例，保险公司会确定赔偿金额。
提交材料：
- 非机动车方需向保险公司提交事故认定书、医疗证明（如住院记录、医疗费发票等）、维修发票（如非机动车受损需维修）、误工证明（如因事故导致误工）等相关材料。
- 确保所有材料真实、完整，以免影响理赔进度。
审核与支付：
- 保险公司会审核提交的材料，确认无误后，按照约定支付赔偿金额。
- 赔偿金额可能包括医疗费、误工费、护理费、交通费、残疾赔偿金（如构成伤残）、财产损失等。
三、理赔原则与注意事项
交强险优先赔付：
- 无论机动车是否有责任，交强险都应在限额内先行赔付非机动车方的损失。
- 交强险赔偿不足的部分，再由商业险或机动车方自行承担。
责任比例分摊：
- 根据事故认定书确定的责任比例，计算机动车和非机动车各自应承担的赔偿金额。
- 例如，若机动车承担70%的责任，则非机动车方的损失中，70%由机动车方（通过保险）承担，30%由非机动车方自行承担。
赔偿项目与标准：
- 赔偿项目包括人身伤亡和财产损失，具体标准根据受害人的实际情况和法律规定确定。
- 人身伤亡赔偿可能包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金等；财产损失赔偿则根据实际损失情况确定。
特殊情况考虑：
- 如果非机动车一方存在故意碰撞机动车等严重过错行为，机动车一方可以适当减轻赔偿责任，甚至可能无需承担赔偿责任。但这要求机动车一方能够提供充分证据证明非机动车驾驶人的故意行为。
争议处理：
- 若对理赔结果有异议，非机动车方可以向保险公司提出申诉或向监管部门投诉。
- 必要时，可以通过法律途径解决争议，如向法院提起诉讼。
四、案例说明
假设一起交通事故中，机动车与非机动车相撞，交警认定机动车承担70%的责任，非机动车承担30%的责任。非机动车方受伤住院，产生医疗费5万元，误工费1万元，财产损失2000元。机动车方投保了交强险和第三者责任险（保额100万元）。
- 交强险赔付：非机动车方的医疗费和财产损失在交强险限额内先行赔付，假设医疗费赔付1万元，财产损失赔付2000元。
- 商业险赔付：剩余医疗费4万元和误工费1万元，共计5万元，由机动车方承担70%，即3.5万元。这部分费用由商业险在保额范围内赔付。
- 非机动车方自负：非机动车方需自行承担剩余30%的费用，即1.5万元。
综上所述，机动车与非机动车事故中非机动车次要责任的赔偿问题涉及多个环节和原则。双方应充分了解相关规定和流程，并积极配合相关部门的调查和调解工作，以确保赔偿事宜得到妥善处理。