针对您提出的问题，即“父亲醉驾拘役两个月发生在儿子入伍之后该怎么办，以及如果没主动申报会怎么样”，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，父亲醉驾并因此被拘役两个月，这一行为如果经过法院判决构成危险驾驶罪，是会留下刑事案底的。这一案底在特定情况下，确实可能对子女的某些政治审查（政审）环节产生影响，尤其是当子女报考公务员、军校、警校等需要严格政审的岗位时。然而，就您提到的儿子已经入伍的情况而言，我们需要具体分析：

1. 关于已入伍的情况：

   • 儿子已经入伍，说明他已经通过了入伍前的政审环节。在一般情况下，入伍政审主要关注的是考生本人的政治思想表现、道德品质等方面，而不会深入涉及旁系亲属（如父亲）的违法犯罪记录，除非该记录对考生本人的政治表现有直接影响或构成重大关联。
   • 既然儿子已经成功入伍，这通常意味着在入伍前的政审中，并未发现足以影响其入伍的负面因素。因此，从这一角度看，父亲醉驾的案底在儿子入伍后可能不会直接导致其被退兵或受到其他不利影响。

2. 关于未主动申报的问题：

   • 如果儿子在入伍前或入伍后，被要求申报家庭成员的违法犯罪记录，而他没有主动申报父亲醉驾的案底，这可能会构成隐瞒或虚假陈述。
   • 隐瞒或虚假陈述在政审或相关审查中是被视为严重问题的，因为它可能影响到审查结果的公正性和准确性。如果因此被发现，儿子可能会面临纪律处分，甚至可能影响其军旅生涯。

3. 建议措施：

   • 主动申报：如果儿子尚未被明确要求申报家庭成员的违法犯罪记录，但考虑到未来可能面临的审查或晋升等环节，建议他主动向所在部队或相关部门申报父亲醉驾的案底，并说明具体情况。
   • 咨询专业意见：儿子可以咨询所在部队的法律顾问或相关部门，了解具体政策规定和可能的影响，以便做出更明智的决策。
   • 保持诚信：无论在何种情况下，保持诚信都是至关重要的。儿子应该认识到，隐瞒或虚假陈述可能会带来更严重的后果。

综上所述，父亲醉驾的案底在儿子入伍后可能不会直接导致其被退兵或受到其他不利影响，但未主动申报可能会构成隐瞒或虚假陈述，从而带来潜在的风险。因此，建议儿子根据具体情况主动申报，并咨询专业意见以做出更明智的决策。