店铺由他人实际经营是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 合法授权经营：

   • 如果店铺的所有者（如房东或原经营者）通过合法的方式，如签订租赁合同、承包合同或委托经营合同等，将店铺的实际经营权授予他人，并且这种授权行为符合相关法律法规的规定（如办理了必要的工商变更登记或备案手续），那么这种由他人实际经营的行为是合法的。
   • 例子：甲将店铺租赁给乙，双方签订了租赁合同，并约定乙负责店铺的日常经营。在这种情况下，乙作为承租人，有权在租赁期内实际经营店铺，这种行为是合法的。

2. 无合法授权经营：

   • 如果店铺的所有者并未通过合法方式将经营权授予他人，或者授权行为存在瑕疵（如未办理工商变更登记、未签订书面合同等），而他人却擅自实际经营店铺，那么这种行为可能构成违法。
   • 法律后果：无合法授权经营店铺可能涉及侵犯原经营者的经营权、商标权等知识产权，或者违反工商行政管理规定，面临行政处罚（如罚款、没收违法所得等）甚至刑事责任（如构成非法经营罪等）。
   • 例子：丙未经甲的同意，擅自进入甲的店铺进行经营。在这种情况下，丙的行为构成无合法授权经营，可能面临法律责任。

3. 特殊情形下的经营：

   • 在某些特殊情形下，如店铺所有者因故无法亲自经营，而委托他人代为管理，但并未明确转让经营权，此时受托人的行为是否违法取决于委托合同的约定以及相关法律法规的规定。
   • 建议：为避免法律纠纷，店铺所有者与受托人之间应签订明确的委托经营合同，约定双方的权利义务、经营期限、收益分配等事项，并办理必要的工商变更登记或备案手续。

法律建议：

• 对于店铺所有者而言，在将店铺实际经营权授予他人时，应确保授权行为的合法性，签订书面合同并办理相关手续，以维护自己的合法权益。
• 对于实际经营者而言，在接受店铺经营权时，应仔细审查授权文件的合法性和有效性，确保自己的经营行为符合法律法规的规定。
• 如果双方在经营过程中发生纠纷，应及时寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。

总结：店铺由他人实际经营是否违法，取决于授权行为的合法性和有效性。为避免法律纠纷和损失，建议双方在经营前签订明确的合同并办理相关手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。