工程查实存在分包后，需根据分包的合法性、分包内容及合同约定等具体情况，采取不同的处理措施。具体分析如下：

1. 若分包合法且符合合同约定：

   • 处理方式：一般来说，合法分包是被允许的，只要分包内容不违反法律法规的强制性规定，且符合主合同中关于分包的约定。在此情况下，工程查实存在分包后，通常无需对分包行为本身进行处罚或纠正，但应确保分包商具备相应的资质和能力，以保证工程质量和进度。
   • 建议：继续履行合同，加强对分包商的管理和监督，确保分包工程符合合同要求。

2. 若分包违法或违反合同约定：

   • 处理方式：
     • 立即停止违法分包行为：一旦发现分包违法或违反合同约定，应立即要求承包商停止分包行为，并采取措施消除影响。
     • 追究违约责任：根据合同约定，追究承包商的违约责任，包括但不限于罚款、赔偿损失等。
     • 解除合同或更换承包商：在严重情况下，如分包行为导致工程质量严重受损或进度严重滞后，可以考虑解除与承包商的合同，并更换符合要求的承包商。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国建筑法》及相关法律法规，违法分包可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得、责令停业整顿、降低资质等级、吊销资质证书等。同时，违法分包还可能导致民事责任，如因分包工程质量问题给发包人造成损失的，承包人应承担赔偿责任。

3. 若分包内容存在争议或不明确：

   • 处理方式：
     • 协商解决：首先尝试与承包商进行协商，明确分包内容、范围及责任等，以达成一致意见。
     • 寻求第三方调解或仲裁：若协商无果，可以寻求第三方调解或仲裁机构进行调解或仲裁，以解决争议。
     • 提起诉讼：在必要时，可以向人民法院提起诉讼，通过司法程序解决争议。
   • 建议：在处理此类争议时，应充分收集证据，包括合同、分包协议、往来函件、会议纪要等，以支持自己的主张。

额外提醒：在处理工程分包问题时，还应关注分包商的资质和信誉情况，确保分包商具备相应的施工能力和经验，以降低工程风险。同时，应加强对分包工程的管理和监督，确保分包工程符合合同要求和质量标准。

总结：工程查实存在分包后，应根据分包的合法性、分包内容及合同约定等具体情况采取不同的处理措施。在处理过程中，应遵守相关法律法规和合同约定，确保工程质量和进度不受影响。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。