总包将建设工程主体进行分包是不合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与原则
根据《中华人民共和国建筑法》第二十九条的规定，建筑工程总承包单位可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位，但施工总承包的，建筑工程主体结构的施工必须由总承包单位自行完成。这一规定明确了主体结构施工不得分包的原则，旨在确保工程的安全和质量。
二、违法分包的情形
将主体结构分包：
- 主体结构关乎建筑的整体安全和稳定性，总承包单位将建筑工程主体结构的施工分包给其他单位，属于严重的违法分包行为。
分包给无资质单位：
- 总承包单位若将工程分包给不具备相应资质条件的单位，同样构成违法分包。这种行为极易导致工程质量问题和安全隐患。
未经发包人同意或违反总承包合同约定分包：
- 如果总承包单位在未取得发包人同意或违反总承包合同约定的情况下擅自分包，该分包行为也不具有合法性。
分包单位再分包：
- 分包单位将其承包的工程再次分包，增加了工程管理的中间环节，使得工程质量和安全管理难度加大，也属于违法分包。
三、法律后果与责任
合同无效：
- 违法分包可能导致分包合同无效，从而使得分包单位无法依据合同主张权利，总承包单位也可能面临合同违约的风险。
工程停工与罚款：
- 违法分包行为一旦被发现，相关部门有权责令工程停工，并对总承包单位和分包单位处以罚款等行政处罚。
刑事责任：
- 在严重的情况下，违法分包行为可能构成犯罪，相关责任人员可能面临刑事责任的追究。
连带责任：
- 根据法律规定，总承包单位和分包单位就分包工程对建设单位承担连带责任。这意味着，如果分包工程出现质量问题或安全事故，建设单位有权向总承包单位和分包单位共同主张权利。
四、合规建议与风险防范
严格遵守法律法规：
- 总承包单位应严格遵守《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规的规定，确保分包行为的合法性。
明确分包条款：
- 在签订总承包合同时，应明确分包的相关条款，包括分包的范围、条件、程序等，以避免后续的法律纠纷。
审慎选择分包单位：
- 总承包单位应审慎选择分包单位，确保分包单位具备相应的资质和条件，能够胜任分包工程的任务。
加强监督与管理：
- 总承包单位应对分包工程的质量与安全进行监督和管理，确保整个工程的质量与安全符合相关标准和要求。
综上所述，总包将建设工程主体进行分包是不合法的，这种行为可能带来严重的法律后果和责任。因此，在实际操作中，总承包单位应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保分包行为的合法性和规范性。如果您在建设工程领域遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询。