结论：实际控制人盖章借款但资金未打入公司账户，且用于个人民间借贷的债务，在破产程序中能否被认定为破产债权，需根据具体情况分析，一般不能直接认定为破产债权，但在特定条件下可能被部分或全部认定。以下从不同角度进行详细分析：
一、破产债权的认定原则
破产债权是指在破产宣告前成立的，对破产人发生的，依法申报确认并得由破产财产中获得公平清偿的财产请求权。其认定需满足以下条件：
- 债权成立时间：必须在破产宣告前成立。
- 债权性质：必须是对破产人（即公司）发生的财产请求权。
- 合法性：债权必须合法有效，不存在无效或可撤销的情形。
二、实际控制人借款行为的性质分析
借款合同主体：
- 若借款合同上明确借款人为公司，且实际控制人以公司名义盖章，但资金未进入公司账户，这可能构成表见代理或无权代理的问题。
- 若借款合同上明确借款人为实际控制人个人，则与公司无关，除非公司事后追认或构成表见代理。
资金用途：
- 资金用于个人民间借贷，表明该借款并非为公司利益而借，因此不符合破产债权中“对破产人发生的财产请求权”的要求。
三、可能被认定为破产债权的情形
公司事后追认：
- 如果公司事后通过股东会决议或其他方式追认该借款为公司债务，且该借款确实用于公司经营或偿还公司债务，则可能被认定为破产债权。
构成表见代理：
- 如果实际控制人的行为构成表见代理，即相对人有理由相信实际控制人有权代表公司借款，且该借款行为在客观上形成具有代理权的表象，则公司可能需承担还款责任，该债务可能被认定为破产债权。但此情形下，公司承担责任后有权向实际控制人追偿。
借款实际用于公司：
- 尽管资金未直接打入公司账户，但如果能证明该借款实际用于公司经营或偿还公司债务，且公司受益，则可能被认定为破产债权。这需要充分的证据支持，如资金流向证明、公司财务记录等。
四、法律建议
对于债权人：
- 在借款时，应明确借款合同主体，确保借款合同上的借款人与实际收款人一致。
- 保留好借款合同、转账记录等证据，以证明借款事实及资金用途。
- 如发现借款被实际控制人挪用，应及时采取法律措施，如起诉实际控制人返还借款或要求公司承担还款责任（如构成表见代理或公司追认）。
对于公司：
- 加强内部管理，防止实际控制人滥用职权损害公司利益。
- 如发现实际控制人以公司名义借款但资金未用于公司，应及时采取措施，如报警、起诉实际控制人等，以维护公司权益。
- 在破产程序中，应积极配合管理人审查债权，提供必要证据，以维护公司及债权人的合法权益。
总结：实际控制人盖章借款但资金未打入公司账户且用于个人民间借贷的债务，在一般情况下不能直接认定为破产债权。但在公司事后追认、构成表见代理或借款实际用于公司等特定条件下，可能被部分或全部认定。如有具体法律问题，可直接向我咨询。