关于扣货款抵其他应收款是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来综合判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：
合同约定角度：
- 如果货物买卖合同中明确约定了，在特定条件下（如买方违约、未按时支付货款等），卖方有权扣留货款以抵偿其他应收款，那么这种行为在合同约定的范围内是合法的。
- 反之，如果合同中没有此类约定，或者约定不明确，那么卖方单方面扣货款抵其他应收款的行为就可能构成违约，需要承担相应的法律责任。
法律规定角度：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方应当遵循诚实信用原则，按照约定履行自己的义务。如果一方未经对方同意，擅自改变合同约定的履行方式，可能构成违约。
- 同时，如果卖方扣货款的行为侵犯了买方的合法权益（如买方已经按照合同约定支付了货款，但卖方仍扣留货款），那么买方有权要求卖方返还货款，并可能要求卖方承担违约责任或赔偿损失。
实际操作角度：
- 在实际操作中，即使合同中有相关约定，卖方在扣货款前也应当与买方进行充分沟通，确保买方了解并同意扣款的原因和金额。
- 如果买方对扣款有异议，卖方应当提供充分的证据证明扣款的合法性和合理性，否则可能面临法律纠纷。
法律建议：
- 对于卖方而言，在签订货物买卖合同时，应当明确约定在何种条件下可以扣货款抵其他应收款，并确保该约定不违反法律法规的强制性规定。
- 在实际操作中，如果确实需要扣货款抵其他应收款，应当与买方进行充分沟通，并保留好相关证据（如合同、沟通记录、扣款通知等），以备不时之需。
- 对于买方而言，如果发现卖方未经同意擅自扣货款，应当及时与卖方沟通并要求返还货款。如果沟通无果，可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果卖方扣货款的行为构成违约或侵权，可能需要承担返还货款、支付违约金、赔偿损失等法律责任。
- 在极端情况下，如果卖方的行为构成犯罪（如诈骗、侵占等），还可能面临刑事处罚。
综上所述，扣货款抵其他应收款是否合法，需要根据合同约定、法律规定以及实际操作情况来综合判断。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。