当电动自行车与机动车相撞，且电动自行车被认定为全责、机动车次责，同时已经涉及保险公司时，处理流程可以归纳为以下几个清晰、详细的步骤：

一、事故现场处理与取证

1. 确保安全：事故发生后，首要任务是确保所有人员的安全。立即停车，开启双闪，并在车后合理位置放置三角警告标志，以防止二次事故。如果有人受伤，应立即拨打120急救电话。

2. 报警与保护现场：拨打122报警电话，报告事故情况，并等待交警到来进行勘查。在等待期间，尽量保持事故现场原状，不要随意移动车辆和证据。如果因抢救伤员等需要移动车辆，应做好标记，并拍照记录。

3. 拍照取证：使用手机或相机拍摄事故现场照片，包括车辆碰撞部位、事故现场全貌、交通标志标线等，这些照片将作为后续处理的重要证据。

4. 记录信息：双方当事人应互相记录姓名、联系方式、车牌号码、驾驶证号码、车辆保险等信息，以便后续联系和理赔。

二、责任认定与保险理赔

1. 责任认定：交警部门会根据事故现场勘查、调查情况以及相关法律法规，出具交通事故责任认定书，明确电动自行车负事故全部责任，机动车负次要责任。

2. 通知保险公司：

   • 机动车方：应及时向自己的保险公司报案，告知事故情况。即使机动车在事故中负次要责任，其交强险也可能在有责任赔偿限额内进行赔付（医疗费用赔偿限额通常为18000元、伤残赔偿限额通常为180000元、财产损失赔偿限额通常为2000元，具体以当地政策为准）。若机动车还投保了商业保险，如车损险、第三者责任险等，也可根据保险合同约定向保险公司申请理赔。
   • 电动自行车方：虽然电动自行车通常不强制购买保险，但如果购买了相关保险（如非机动车第三者责任险），也应及时向保险公司报案。

3. 赔偿协商：

   • 电动自行车车主需对机动车的损失承担主要赔偿责任，包括维修费用、施救费用等。同时，如果机动车一方人员受伤，电动自行车车主还需承担医疗费用、误工费、护理费等合理损失。机动车方因其次要责任，也需承担部分损失，但具体比例需根据责任认定书确定。
   • 双方可以根据交警出具的责任认定书，就赔偿事宜进行协商。如能达成一致，可签订赔偿协议并履行。

4. 保险理赔流程：

   • 机动车方或电动自行车方（如购买了保险）向保险公司提交理赔申请，提供事故责任认定书、照片、维修发票、医疗费用单据等相关证据。
   • 保险公司审核理赔申请，根据保险合同约定和事故责任认定书确定赔偿金额。
   • 保险公司支付赔偿款项给被保险人或直接支付给受损方（如机动车维修厂、医院等）。

三、赔偿协商不成时的处理

1. 调解处理：若双方协商不成，可请求交警部门进行调解。交警部门会依法对赔偿问题进行调解，并出具调解协议书。

2. 法律途径：若调解不成，机动车一方或电动自行车一方可向人民法院提起民事诉讼，通过法律途径解决争议。诉讼时需提供相关证据支持诉求，如事故责任认定书、照片、维修发票、医疗费用单据等。

四、注意事项

1. 保留证据：保留所有与事故相关的医疗、维修等费用单据，以及事故责任认定书、照片等证据，以便后续赔付或诉讼时使用。

2. 咨询专业人士：在处理过程中，建议咨询专业律师或保险公司，以确保自身权益得到妥善处理。特别是对于赔偿项目的计算、保险理赔的流程等，专业人士能提供更准确的指导。

综上所述，当电动自行车与机动车相撞且电动自行车被认定为全责、机动车次责时，双方应冷静应对，按照法定程序处理事故现场、认定责任、进行保险理赔及协商赔偿。如协商不成，可通过法律途径解决争议，维护自身合法权益。