当企业面临员工工资卡被冻结，且员工申请通过亲属卡来发放工资的情况时，企业需要采取一系列合法合规且细致周到的措施来应对。以下是企业可以遵循的详细处理步骤和建议：
一、核实冻结情况
获取法律文件：
- 企业应要求员工提供法院冻结其银行卡的相关法律文书，如协助执行通知书、裁定书等。
- 通过法院的官方联系方式，核实这些法律文书的真实性、冻结的具体金额以及冻结期限。
了解冻结原因：
- 与员工进行深入沟通，明确其银行卡被冻结的具体原因。
- 评估这一冻结情况可能对企业和员工带来的潜在风险。
二、内部合规审查
查阅规章制度：
- 检查企业内部是否有关于工资支付至第三方账户的具体规定。
- 如果企业内部没有相关规定，可以通过合法程序，如召开职工代表大会，来制定相应的规范。
法务/人力资源审核：
- 将员工的请求以及法院提供的法律文件提交给公司的法务部门或人力资源部门。
- 由这些专业部门评估法律风险，并确认政策是否允许这种支付方式的变更。
三、签订委托协议
变更支付方式申请：
- 要求员工填写正式的变更工资支付方式申请，明确提供家属的详细信息、支付方式以及账号。
关系证明：
- 员工需要提供与家属的关系证明，如户口本、结婚证等，以证明其与家属的合法关系。
签署协议：
- 双方应签署一份委托支付协议，明确各自的权利义务、法律责任以及支付期限。
- 确保协议中明确指出，企业将工资支付至家属卡后，即视为已履行了对员工的工资支付义务。
四、财务操作与记录
合规支付：
- 财务部门应按照正常流程，将工资打入员工指定的家属卡中。
- 详细记录支付情况，包括支付日期、金额、支付方式等，并保留相关凭证。
税务处理：
- 工资支付至家属卡并不影响税务处理。
- 企业仍需按照规定代扣代缴员工的个人所得税。
五、风险防范与持续管理
告知风险：
- 提醒员工及其家属关于资金安全的风险，如可能存在的诈骗、盗刷等。
- 要求员工承担因支付方式变更而可能出现的所有风险。
持续关注：
- 定期与员工沟通，了解其银行卡的冻结状态。
- 一旦冻结解除，应及时恢复正常工资发放方式。
六、员工方面的配合
主动沟通与配合：
- 员工应立即向企业说明其银行卡被冻结的情况，并提供所需的法律文件。
- 积极配合企业完成变更支付方式的相关手续。
关注资金安全与管理：
- 提醒家属妥善保管工资款项，避免发生纠纷或损失。
- 定期与家属核对工资到账情况，确保资金安全无误。
遵守法律法规：
- 员工应了解并遵守当地关于工资支付、银行卡冻结等方面的法律法规。
- 如有需要，可咨询法律顾问以获取更准确的指导。
综上所述，处理员工银行卡被冻结后的工资支付方式变更，需要企业与员工双方密切配合，遵循合法合规的流程。通过核实情况、内部审查、签订协议、财务操作与记录以及风险防范等步骤，企业可以有效管理此类特殊情况，确保双方权益不受损害。