刑事案件经过三次复查后，通常会进入终结审查程序，但具体处理方式需结合案件阶段和复查结果来判断。以下是具体分析：

1. 若案件处于检察院复查阶段
   根据《人民检察院刑事诉讼规则》第594条，检察院对已生效的刑事判决、裁定提出抗诉或再审检察建议后，若法院未启动再审程序，检察院可进行复查。复查次数一般无明确限制，但实践中以三次为常见上限。若三次复查后仍维持原结论（如认为法院判决无误），检察院将作出《终结审查决定书》，案件正式结案，不再继续复查。

2. 若案件处于法院再审阶段
   若三次复查是法院对再审申请的审查（如当事人多次申请再审），根据《刑事诉讼法》第257条，法院对再审申请的审查次数通常以一次为原则，但特殊情况下可能多次审查。若三次审查后法院仍裁定驳回再审申请，案件将彻底终结，当事人无法再通过常规程序申请再审。此时，若当事人认为存在重大冤错，可尝试通过申诉途径向上级法院或检察院反映，但申诉不必然启动再审程序。

3. 特殊情形：发现新证据或程序违法
   若在复查过程中发现新证据（如物证、证人证言等）或原审判程序存在重大违法（如审判人员受贿、刑讯逼供等），即使已复查三次，检察院或法院仍可能依法启动抗诉或再审程序。此时案件将重新进入诉讼流程，原判决可能被撤销或改判。

建议行动：

• 若您是当事人或家属，可要求复查机关出具书面结论（如《终结审查决定书》或《驳回再审申请通知书》），明确案件状态；
  
• 若认为复查结论存在错误，可向上级机关（如上级检察院或法院）提出申诉，但需准备充分证据证明原判决确有错误；
  
• 若案件涉及重大冤错可能，可联系律师协助梳理证据，通过法律监督程序（如向检察院申请立案监督）推动案件重启。
  

提示：刑事案件复查程序复杂，且各地司法实践存在差异。若需进一步分析案件走向或制定应对策略，可直接向我提供案件细节（如原判决罪名、复查机关结论等），我将结合具体情形为您详细解答。