结论：甲方借条写的是五万，但甲方儿子住院时医院用POS机刷了乙方一万多，这一万多是否受法律保护，取决于该款项的性质以及双方的具体约定和证据情况。以下从不同角度进行分析：

1. 款项性质与借条关系：

   • 如果这一万多块钱是乙方基于甲方的借款请求，通过POS机支付给医院作为甲方的借款使用，且双方有明确的借款合意（如口头或书面约定），那么这一万多块钱应当视为借款的一部分，受法律保护。此时，借条上的五万可能包含了这一万多，也可能不包含，需要看借条的具体内容和双方的实际约定。
   • 如果这一万多块钱是乙方出于其他原因（如赠与、帮助等）支付给医院的，且没有明确的借款合意，那么这一万多块钱可能不被视为借款，不受借条的法律约束。

2. 证据情况：

   • 无论款项性质如何，证据都是关键。乙方需要提供证据证明这一万多块钱是支付给甲方的借款，如转账记录、聊天记录、证人证言等。如果乙方无法提供充分证据，可能面临举证不能的风险，即法院可能无法认定这一万多块钱为借款。
   • 对于甲方而言，如果其认为这一万多块钱不是借款，也需要提供相应证据进行反驳，如证明该款项是乙方赠与、帮助或其他性质的支付。

3. 法律后果：

   • 如果法院认定这一万多块钱为借款，且甲方未按照约定还款，乙方有权要求甲方还款，并可能要求甲方支付逾期利息等。
   • 如果法院认定这一万多块钱不是借款，乙方则无法基于借条要求甲方还款，但可能基于其他法律关系（如不当得利等）寻求救济。

建议：

• 对于乙方而言，建议尽快收集并整理相关证据，如转账记录、聊天记录等，以证明这一万多块钱是支付给甲方的借款。同时，可以与甲方进行沟通，尝试达成还款协议或补充借条等书面文件，以明确双方的权利义务。
• 如果双方无法协商解决，乙方可以考虑向法院提起诉讼，要求甲方还款。在诉讼过程中，乙方需要积极举证，证明自己的主张。
• 对于甲方而言，如果认为这一万多块钱不是借款，也需要积极准备证据进行反驳，并可以考虑与乙方进行沟通协商，以避免不必要的法律纠纷。

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