结论：员工通过微信将盖有公司公章的合同传给对方公司，合同是否有效需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 合同生效的一般要件：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效通常需要满足行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定以及不违背公序良俗等条件。
   • 在此情况下，如果合同内容本身合法，且双方公司均具备签订合同的民事行为能力，员工通过微信传输合同的行为，若被视为公司授权或追认的行为，则合同在形式上可能满足生效要件。

2. 公章的效力：

   • 公章是公司对外表示意思的重要工具，具有法律效力。盖有公司公章的合同，通常被视为公司对合同内容的认可和承诺。
   • 如果员工在传输合同时，确实获得了公司的授权或事后得到了公司的追认，且公章的使用符合公司规定，那么该合同对公司具有约束力。

3. 微信传输合同的特殊性：

   • 微信作为一种电子通讯方式，其传输的合同文本在形式上可能不同于传统的纸质合同。然而，随着电子签名法的实施和电子商务的发展，电子合同也逐渐被法律所认可。
   • 如果双方公司均同意以微信传输的方式签订合同，并且该方式不违反法律法规的强制性规定，那么通过微信传输的盖有公司公章的合同，在符合其他生效要件的情况下，也是有效的。

4. 可能存在的风险及防范：

   • 风险：员工未经授权擅自使用公司公章或传输合同，可能导致公司面临法律风险，如合同无效、承担违约责任等。
   • 防范：公司应建立健全公章管理制度，明确公章的使用权限和流程；同时，加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识和风险防范能力。如果发生员工擅自使用公章或传输合同的情况，公司应及时采取措施，如向对方公司发出书面声明、寻求法律救济等。

5. 实际案例参考：

   • 在实际司法实践中，法院在判断通过微信等电子方式传输的合同是否有效时，会综合考虑合同内容、双方公司的意思表示、公章的使用情况以及相关法律法规的规定等因素。
   • 如果合同内容合法、双方公司意思表示真实且一致、公章使用符合规定，那么即使是通过微信传输的合同，也可能被法院认定为有效。

建议：为了确保合同的有效性并降低法律风险，公司应尽可能采用传统的纸质合同方式签订合同，并在合同上加盖公司公章。如果确实需要采用电子方式签订合同，应确保双方公司均同意该方式，并采取必要的措施保障合同的安全性和真实性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。