在一审就已存在但再审时才由原申请人提交的银行流水和合同文件，一般不算作新证据。不过，是否构成新证据，还需结合具体情况进行判断，以下从不同角度进行分析：
一、新证据的一般认定标准
在法律程序中，新证据通常指的是在原审庭审结束后新发现的证据，或者是在原审庭审结束前已经存在，但因客观原因无法取得或在规定期限内不能提供的证据。对于一审时就已经存在且能够取得的证据，如银行流水和合同文件，原则上应当在一审时提交，否则可能被视为放弃举证权利。
二、具体情境下的判断
若因客观原因无法取得：
- 如果在一审时，原申请人确实因客观原因（如银行系统故障、合同文件被对方控制且拒绝提供等）无法取得这些证据，且在再审时能够提供充分证据证明这些客观原因的存在，那么这些证据有可能被认定为新证据。
若因主观原因未提交：
- 如果原申请人在一审时已经能够取得这些证据，但出于某种主观原因（如疏忽、故意隐瞒等）未提交，那么在再审时提交这些证据，通常不会被认定为新证据。此时，法院可能会认为原申请人已经放弃了举证权利，或者认为这些证据不足以改变原审判决的结果。
证据的证明力与关联性：
- 即使某些证据被认定为新证据，法院还会进一步审查其证明力和关联性。如果新证据与案件事实无直接关联，或者其证明力不足以推翻原审判决，那么这些证据也可能不会被采纳。
三、法律建议
及时举证：
- 在诉讼过程中，当事人应当及时、全面地提交证据，以支持自己的主张。避免因为疏忽或故意隐瞒而错过举证时机。
保留证据原件：
- 对于重要的证据，如银行流水和合同文件，当事人应当妥善保管原件，并在需要时及时提供给法院。复印件或扫描件等可能因真实性、完整性等问题而影响其证明力。
咨询专业律师：
- 在诉讼过程中，如果当事人对证据的提交、认定等方面存在疑问或困惑，应当及时咨询专业律师。律师可以根据当事人的具体情况和案件事实，提供有针对性的法律建议和指导。
总结来说，一审就已存在但再审时才提交的银行流水和合同文件，一般不算作新证据。不过，具体是否构成新证据还需结合客观原因、主观意图以及证据的证明力和关联性等因素进行综合判断。如果你在这方面还有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。