破产程序结束后，若有新申报的债权，管理人通常应按以下方式处理：

1. 审查新债权的申报材料
   管理人首先需对新申报的债权进行形式审查，包括债权申报书、相关证据材料（如合同、发票、付款记录等）是否齐全，申报主体是否适格（如债权人是否具有诉讼主体资格），以及申报的债权是否在破产程序终结前已存在但未申报（需区分“已知债权”与“未知债权”）。若材料不完整，管理人应通知申报人补正；若材料明显不符合要求（如债权已过诉讼时效、申报主体不适格），可直接不予认定。

2. 核实债权是否符合“新发现债权”条件
   根据《企业破产法》及相关司法解释，破产程序终结后新申报的债权需满足“在破产程序终结前已存在但未申报”的条件。若债权是因破产程序终结后新发生的事实（如后续产生的违约金、利息等）产生的，则不属于破产债权，管理人应告知申报人通过其他法律途径（如普通民事诉讼）主张权利。
   例如：若债权人在破产程序终结后发现债务人曾隐匿财产，导致其债权未获清偿，该债权仍属于破产程序终结前已存在的债权，可申报；但若债权是因破产程序终结后债务人新签订的合同产生的债务，则不属于破产债权。

3. 区分破产程序终结方式，确定处理路径

   • 若破产程序因“破产财产分配完毕”终结：根据《企业破产法》第123条，自破产程序终结之日起二年内，债权人可请求人民法院按照破产财产分配方案追加分配。管理人应将新申报的债权材料提交法院，由法院裁定是否追加分配。若法院裁定追加分配，管理人需协助执行分配方案；若裁定驳回，管理人应告知申报人救济途径（如申请复议或提起诉讼）。
     
   • 若破产程序因“重整计划执行完毕”或“和解协议执行完毕”终结：根据《企业破产法》第94条、第106条，重整计划或和解协议对债务人和全体债权人均有约束力，未申报的债权在重整计划或和解协议执行完毕后不得再行申报。管理人应直接告知申报人，其债权已因未申报而丧失受偿权利，但可依据重整计划或和解协议中的“未申报债权处理条款”（如有）主张权利，或通过普通民事诉讼向债务人主张（但需注意诉讼时效问题）。

4. 告知申报人救济途径
   若管理人不予认定新申报的债权，或法院裁定驳回追加分配申请，申报人仍有权通过以下途径救济：

   • 申请复议：对管理人的不予认定决定或法院的裁定不服的，可在收到通知之日起15日内向作出裁定的法院申请复议；
     
   • 提起诉讼：若复议被驳回，或直接对管理人的决定不服的，可向法院提起破产债权确认之诉，由法院通过诉讼程序重新审查债权的真实性、合法性及金额。

总结：破产程序结束后新申报的债权，管理人需先审查材料、核实债权性质，再根据破产程序终结方式确定处理路径（追加分配或直接驳回），并告知申报人救济途径。具体操作需结合债权性质、破产程序终结原因及证据材料综合判断，建议申报人及时咨询专业律师以维护权益。