工程款可以以第三方评估价格来结算，但需满足一定条件并遵循相关法律规定。以下从不同角度为你详细分析：

1. 合同约定优先
   若工程合同中明确约定“工程款结算以第三方评估价格为准”，则双方应按合同履行。根据《民法典》第509条，当事人应全面履行合同义务，因此第三方评估结果可直接作为结算依据。
   例外情形：若评估机构选择程序违法（如未通过招标或双方共同委托）、评估方法明显不合理，或评估人员存在利害关系，一方可依据《民法典》第153条主张条款无效，或要求重新评估。

2. 合同未约定时的处理
   若合同未明确约定评估结算，但双方事后达成补充协议同意第三方评估，则评估结果具有法律效力。根据《民法典》第510条，合同生效后未约定事项可协商补充，补充协议与原合同具同等效力。
   若无法达成一致：可依据《建设工程价款结算暂行办法》第16条，通过诉讼或仲裁委托鉴定机构评估，但需注意：

   • 鉴定机构需由法院/仲裁机构委托，而非单方自行委托；
     
   • 评估范围通常限于争议部分（如工程量、材料价差），而非全盘推翻原合同价款。

3. 评估机构的资质与程序要求
   第三方评估机构需具备相应资质（如工程造价咨询企业资质），且评估程序需合法合规：

   • 委托主体：宜由双方共同委托，避免单方委托导致对方质疑公正性；
     
   • 评估方法：需符合行业规范（如《建设工程工程量清单计价规范》）；
     
   • 异议处理：若一方对评估结果有异议，可要求评估机构解释或申请重新评估。

4. 风险提示

   • 评估成本：第三方评估可能产生较高费用（如数万元至数十万元），需在合同中约定费用承担方；
     
   • 时效问题：评估需在诉讼时效内完成，否则可能丧失主张权利的依据；
     
   • 证据固定：若发现对方恶意拖延评估或提供虚假材料，应及时固定证据（如书面催告记录、现场照片）。

建议：

1. 签订合同时明确约定评估条款（如评估机构选择方式、评估范围、费用承担）；
   
2. 争议发生后优先协商，协商不成时及时委托专业机构评估并留存书面证据；
   
3. 若涉及复杂工程或大额款项，可同步咨询律师审查合同条款或评估报告合法性。
   

如有具体合同文本或争议细节，可进一步向我提供，我会结合实际情况为你分析风险点及应对策略。