关于建设单位是否可以将门窗工程单独发包的问题，这确实是一个涉及法律法规、工程性质及合同约定等多方面的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：

一、直接发包的法律依据与条件

根据《房屋建筑和市政基础设施工程施工分包管理办法》等相关规定，建设单位在特定条件下有权直接发包门窗工程。这些条件主要包括：

1. 工程性质与规模：若门窗工程不属于必须进行招标的项目范围，且工程总投资额较小或单项合同估算价未达到法定招标规模标准，建设单位可以直接发包。
2. 特殊技术要求：当门窗工程采用特殊工艺或新型材料，只有特定供应商具备技术和施工能力时，建设单位可直接发包以满足项目需求。

二、直接发包应遵循的要求

即使满足直接发包的条件，建设单位在发包过程中也需遵循以下要求：

1. 资质审查：确保承接单位具备建筑门窗工程专业承包资质，并根据工程规模和复杂程度选择合适资质等级的企业。
2. 合同签订：必须签订书面合同，明确双方权利义务，包括工程范围、质量标准、工期、价款支付方式及违约责任等。
3. 备案手续：部分地区要求将直接发包情况向当地建设行政主管部门备案，提交相关资料以接受行政监管。

三、必须招标项目的限制

若项目整体属于必须进行招标的范围，且门窗工程作为其中一部分达到了法定招标规模标准（如施工单项合同估算价在400万元人民币以上），则必须通过招标程序确定承包人，不能直接发包。

四、分包与直接发包的区别及注意事项

1. 分包情况：在常规情况下，建设单位不应直接将门窗工程分包出去，除非总承包合同中有明确约定或经总承包单位书面同意。分包时，也需确保分包单位具备相应资质，并签订明确的分包合同。
2. 直接发包与分包的选择：建设单位应根据工程性质、规模、法律法规及合同约定等因素综合考虑发包方式。直接发包适用于小型、非主体结构或具有特殊技术要求的门窗工程；而分包则更多依赖于总承包合同的约定或总承包单位的同意。

五、建议与总结

为确保决策合法合规，建议建设单位在发包前咨询专业法律顾问或相关部门，以获取准确的法律意见和指导。同时，无论选择直接发包还是分包，都应注重保护施工单位的合法权益，促进建筑市场的健康发展。在发包过程中，建设单位应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保工程质量和施工安全。

综上所述，建设单位在特定条件下可以将门窗工程单独发包，但必须满足相关法律法规和合同约定的要求，并遵循公平、公正、公开的原则进行发包。