当合同中的付款金额约定不明确时，你们双方可以按照以下步骤来处理：
优先协商补充：
- 根据《中华人民共和国民法典》第五百一十条的规定，合同生效后，若当事人发现价款等内容没有约定或约定不明确，应优先通过协商达成补充协议。这是最直接且高效的方式，能够体现双方的意思自治，避免后续的纠纷。
- 例子：比如，你们双方签订了一份买卖合同，但合同中只约定了货物的数量和种类，没有明确约定价款。这时，你们可以通过协商，根据市场价格或双方都能接受的价格来补充约定价款。
参考合同相关条款或交易习惯：
- 若协商无果，接下来应依据合同的其他相关条款或交易习惯来确定价款。
- 合同相关条款：检查合同中是否有其他与价款相关的间接约定，如总价按市场价格的一定比例计算等。这些条款虽未直接明确价款，但可作为推断价款的依据。
- 交易习惯：考虑当事人之间长期形成的交易方式或行业内普遍遵循的价格确定方式。例如，特定行业中的季节定价习惯等，这些习惯反映了市场的通常做法，可作为确定价款的参考。
- 例子：如果你们双方之前有过类似的交易，且每次都按照某个固定的价格或比例来结算，那么这次也可以参照这个交易习惯来确定价款。
按照法定标准执行：
- 若上述方法均无法确定价款，则需按照法定标准来履行。
- 市场价格：根据《中华人民共和国民法典》第五百一十一条第二项的规定，当事人就价款约定不明确且无法通过其他方式确定的，应按照订立合同时履行地的市场价格来履行。这里需特别注意“订立合同时”和“履行地”两个关键要素，以确保价格的合理性和地域的适用性。
- 政府定价或政府指导价：对于属于政府定价或政府指导价范围的商品或服务，应严格按照政府规定的价格来履行。若合同约定的交付期限内政府价格发生调整，则根据交付时间点的价格来计价；对于逾期交付或提取标的物、逾期付款的情况，也均有明确的法律规定来确保交易的公平性。
- 例子：如果你们签订的是一份涉及政府定价的商品买卖合同，如电力、自来水等，那么当合同中的价款约定不明确时，就应按照政府规定的价格来履行。
在处理此类问题时，还需要注意以下几点：
- 及时沟通：一旦发现合同中的付款金额约定不明确，双方应及时沟通，避免因为拖延而导致纠纷的升级。
- 保留证据：在协商和补充约定的过程中，双方应保留好相关的证据，如聊天记录、邮件、书面协议等，以备不时之需。
- 寻求法律帮助：如果双方无法就付款金额达成一致，且无法通过其他方式解决纠纷，那么可以寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式来解决争议。
最后，我想强调的是，合同是双方意思自治的体现，因此在签订合同时，双方应尽可能明确、具体地约定各项条款，包括付款金额、付款方式、付款时间等，以避免后续的纠纷和争议。如果你在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。