针对您提出的“学校协议书没盖章是否有效以及该怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，关于协议书没盖章是否有效的问题，这主要取决于协议书的性质和双方当事人的约定。一般来说，在合同或协议书中，双方当事人的签字或盖章是确认合同内容协商一致、合同成立并生效的重要形式。如果协议书明确规定了需要盖章才能生效，那么没有盖章的协议书在法律上可能被视为未成立或无效。然而，如果双方已经实际履行了协议书中的主要义务，并且对方接受了这种履行，那么即使协议书没有盖章，也可能被视为双方已经达成了合意，协议书仍然可能被认定为有效。但这种情况较为特殊，且需要具体证据支持。
针对您的情况，我建议您采取以下措施：
检查协议书内容：首先，仔细阅读协议书，查看是否有关于盖章的具体规定。如果协议书明确要求盖章，那么您需要尽快与对方协商，补盖公章或相关印章。
与对方沟通：如果协议书没有明确规定盖章的要求，或者您认为双方已经通过实际履行达成了合意，那么您可以与对方进行沟通，说明情况并寻求对方的确认。如果对方认可协议书的效力，那么您可以要求对方出具书面确认函或补充盖章。
寻求法律帮助：如果对方拒绝确认协议书的效力或拒绝补盖公章，并且您认为协议书对您具有重要法律意义，那么您可以考虑寻求法律帮助。您可以咨询专业律师，了解您的权利和义务，以及可能采取的法律措施。
考虑重新签订协议书：如果协议书确实因为未盖章而存在法律风险，且双方无法就补盖公章达成一致，那么您可以考虑与对方重新签订一份符合法律要求的协议书，以确保双方的权益得到保障。
总之，协议书没盖章是否有效取决于具体情况和双方当事人的约定。为了确保您的权益得到保障，我建议您尽快与对方沟通并采取相应措施。如果需要进一步的法律帮助或咨询，请随时告诉我。