结论前置：员工在职期间，用人单位一般不可以将员工的工资全部扣除，但在特定情况下，用人单位可以依法扣除员工部分工资。

详细分析：

1. 一般情况下的工资支付原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，除非有法定或约定的扣除情形，否则用人单位不得随意扣除员工的工资。

2. 可以扣除工资的法定情形：

   • 代扣代缴个人所得税：用人单位有义务根据国家税收法规，从员工工资中代扣代缴个人所得税。
   • 代扣代缴社会保险费用：用人单位和员工都有义务参加社会保险，用人单位可以从员工工资中代扣代缴员工应承担的社会保险费用。
   • 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费：如果员工有法院判决或裁定中要求支付的抚养费、赡养费等，用人单位可以根据相关法律文书从员工工资中代扣。
   • 因员工本人原因给用人单位造成经济损失的赔偿：如果员工因本人原因给用人单位造成了经济损失，用人单位可以按照劳动合同的约定要求员工赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可以从员工本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

3. 不可以扣除工资的情形：

   • 未经员工同意或法定程序：用人单位不得未经员工同意或未经法定程序，擅自扣除员工工资。例如，用人单位不得以罚款、克扣工资等方式惩罚员工，除非这些行为有明确的法律依据或劳动合同约定。
   • 超出法定或约定范围：即使存在可以扣除工资的情形，用人单位也不得超出法定或约定的范围进行扣除。例如，在扣除经济损失赔偿时，不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。

4. 法律后果：

   • 如果用人单位违反规定，擅自扣除员工工资，员工有权向劳动行政部门投诉，要求用人单位支付被扣除的工资，并可能获得相应的赔偿。
   • 在严重情况下，用人单位还可能面临行政处罚或法律责任。

建议与行动：

• 员工方面：如果员工发现用人单位擅自扣除工资，应首先与用人单位沟通协商，要求支付被扣除的工资。如果协商无果，可以向当地劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁。
• 用人单位方面：用人单位应严格遵守相关法律法规和劳动合同约定，不得擅自扣除员工工资。在需要扣除工资时，应确保扣除行为有明确的法律依据或劳动合同约定，并遵循法定程序和范围进行扣除。

总结：员工在职期间，用人单位一般不可以将员工的工资全部扣除。但在特定情况下，如代扣代缴个人所得税、社会保险费用、法院判决要求的抚养费等，以及因员工本人原因给用人单位造成经济损失的赔偿时，用人单位可以依法扣除员工部分工资。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。