针对部队倒查20年发现违规问题对已退休多年当事人的处理方式，需结合违规性质、责任程度及现行法规综合判断，具体分析如下：

1. 责任认定与追责原则
   根据《中国共产党纪律处分条例》及军队相关纪律规定，违规行为的追责不受职务、岗位变动或退休时间限制。若违规行为构成违纪违法（如贪污、受贿、滥用职权等），即使当事人已退休多年，仍可能被追究党纪、政务或刑事责任。但需注意：
   

• 时效性：刑事追诉需符合《刑法》规定的追诉时效（如法定最高刑为5年以下有期徒刑的，追诉期为5年）；若违规行为不构成犯罪但违反党纪，则不受追诉时效限制。
  
• 因果关系：需证明违规行为与当前损害结果存在直接关联，若行为已过时效或无实际危害，可能减轻或免除责任。

1. 具体处理方式

   • 党纪处分：若违规行为违反党纪（如违反廉洁纪律、工作纪律等），可依据《中国共产党纪律处分条例》给予警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看或开除党籍处分。退休人员若被开除党籍，其退休待遇可能按相关规定调整。
     
   • 政务处分：若违规行为违反行政纪律（如滥用职权、玩忽职守等），可依据《中华人民共和国公职人员政务处分法》给予警告、记过、记大过、降级、撤职或开除处分。退休人员若被开除公职，其退休金、补贴等可能被取消或降低。
     
   • 刑事责任：若违规行为构成犯罪（如贪污罪、受贿罪等），需移送司法机关处理。退休人员若被判处刑罚，其退休待遇将按《关于事业单位工作人员和机关工人被采取强制措施和受行政刑事处罚工资待遇处理有关问题的通知》等规定调整（如暂停发放退休金，服刑后按降低后的标准领取）。
     
   • 经济追责：若违规行为涉及经济利益（如违规领取补贴、侵占公款等），需依法追缴违法所得，并可能处以罚款。

2. 程序要求

   • 调查程序：部队需依法依规启动调查程序，收集证据、听取当事人陈述，确保程序合法。
     
   • 权利保障：当事人有权申请回避、申辩、申诉，部队需保障其合法权益。
     
   • 结果通知：处理决定需书面通知当事人，并告知其救济途径（如申请复核、申诉等）。

3. 特殊情形处理

   • 死亡或丧失行为能力：若当事人已死亡或丧失行为能力，可能终止追责程序，但违法所得仍需追缴。
     
   • 情节轻微：若违规行为情节轻微且未造成严重后果，可能免予处分，但需进行批评教育或诫勉谈话。

建议：若您或家人涉及此类问题，建议尽快整理相关证据（如任职文件、违规行为记录等），并详细说明违规性质、时间、后果等信息，以便进一步分析责任类型及处理可能性。如有疑问，可直接向我咨询具体法律适用问题。